1977，溝呂木真也誕生。
1982，姫矢準、西條凪誕生。
1985，孤門一輝誕生。
1989，來訪者墜落在美國的沙漠地帶。
1991，西條凪的母親及其擔任主任研究員的父親被異生獸殺害於美國科羅拉多州。
針對來訪者的普羅米修斯計劃開始研發。
溺水的孤門為“宇宙人”所救。
1992，吉良澤優（預知者）、千樹憐等優秀遺傳基因之子誕生。
2004，藍光（theone）與紅光（thenext）降落在地球上。
原空中自衛隊軍官真木舜一與thenext合為一體並同theone在東京新宿展開交戰。
thenext最終獲勝。後來，來訪者將全世界人民關於theone和thenext的記憶全部消除。
被破壞的新宿地區被政府以“受巨大隕石衝擊”為名將事實掩蓋起來。
鬆永要一郎從內閣情報調查室調任至tlt－j。
鬆永要一郎的夫人在新宿事件中罹難。
2007，溝呂木真也離開夜襲隊，並成為黑暗梅菲斯特。
2008，孤門一輝加入夜襲隊。第二適能者姫矢準接受了光的力量成為奧特曼，並開始了奈克賽斯的戰鬥。
2009，千樹憐設法來到日本，並開始在遊樂園打工。
姫矢準在與溝呂木真也變身的黑暗梅菲斯特的決戰中失蹤。
第三適能者千樹憐繼承了奧特n之光。
縮水部分真相
一、奈克賽斯係列的縮水是從tv版的第25話之後開始的。所謂縮水，不僅僅是刪除集數而已，而是連劇情都大大更改。原案的第25~52話的部分內容在tv版中被刪改的麵目全非。除此之外，劇場版奈克斯特續篇之安魂曲也沒能實現。
二、在原案中，過渡集（25）後，千樹憐篇（26~38）共有7隻異生獸，分彆是古蘭特拉（26~28），班匹拉（29~30），理紮理阿蘇、理紮理阿蘇·穀羅拉（31~33），拜格巴尊·布魯德（34~35），黑暗路西法（僅鏡頭，非正體，36），梅嘎福拉什（37~38），伽魯貝洛斯ex（38）。在原案中，西條凪篇（39~47）共有6隻異生獸，西條凪將變成奈克賽斯奧特曼未知成年形態同它們戰鬥。西條凪變身成為未知成年形態的是女性奧特曼。
最終西條凪將被黑暗吞噬變身為黑暗紮基並暴走（46~47）。黑暗紮基的“zagi”則是西條凪的“凪”（nagi）中的“n”顛倒成“z”以後形成的。之後是在吸收了黑暗紮基的力量後的石堀光彥變成的黑暗路西法猖獗肆虐的過渡集（48~50），最終便進入孤門一輝篇（50~52）。
三、在原案中，失去記憶的溝呂木真也在被抓去tlt後便經受了痛不欲生的人體試驗，他是在人體試驗的刺激之下恢複記憶的。恢複記憶的溝呂木真也先找到機會強行素身越獄去找山邑理子，後被西條凪、孤門一輝、野野宮瑞生軟硬兼施地勸回，關在牢獄之中。瑞生後來應該有幫溝呂木實現見理子的願望。之後會有溝呂木真也關於西條凪、黑暗梅菲斯特等等的展現過的或未展現過的回憶的補完。當西條變成了黑暗紮基時，溝呂木在牢獄之中感知到了這件事情。像先前姬矢準逃出tlt的模式一般，溝呂木真也瞬間移動到戶外並變身為光明梅菲斯特（眼燈是紅色的），欲阻止並拯救西條凪卻失敗，被黑暗紮基重創而恢複人形。最終成功地拯救了西條的是孤門。
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