柯南和世良真純一起找到了被綁架的約翰社長，回去後卻得到消息，阿蘭會長失蹤了。
他是十五年前那那個讚助商綁架案時，在任的fbi局長。柯南馬上推測出，這很可能是十五年前那個案件的報複。
列車因為中午的醫院超導事件，上麵決定磁懸浮列車首發不載人。本來的首發乘客們，全部改乘新乾線去芝濱站。
但大家可以在首發的站台上觀看列車發車。
柯南踢出煙花，轉移了彆人視線的時候，和世良真純一起衝進了超導磁懸浮列車打開的車門裡。車門關上，列車啟動了。
列車裡，柯南和世良真純走進一節節車廂，開始查看起裡麵的情況。
“要是阿蘭會長不在列車上，咱倆可不是挨一頓罵就完事了。”世良真純走在車廂過道上，左右看著。
柯南抬頭動了動鼻子，開口說道：“你聞，這裡有什麼味道？”
“什麼？”正這時，世良真純腳地上踹到了什麼，一支筆飛了出去。
柯南隔著手絹撿起筆：“這是阿蘭會長的。”
“誒？真是他的嗎？”
“對了，你在機場看到的犯人，他的行李車上，有幾個行李箱？”柯南回頭看向世良真純。
世良真純凝神回憶：“兩個，而且是兩個一樣的箱子。”
柯南回憶起裝走約翰社長的箱子，是拉鏈式的，他摸了摸地毯，確認了聞到的酸甜味道，打開了手表上的紅外線。
順著和光產生反應的綠色軌跡，確認了營養飲料粘到了行李輪上。
兩人順著軌跡繼續往前。
突然，後麵遠處似乎傳來了一聲槍響。
柯南拿著手機：“我們現在會儘快找到阿蘭會長。”
“柯南。”世良真純喊了一聲，“剛才那是槍聲吧？而且是栓動式步槍。能不能告訴我，從剛才開始，你一直電話在聯係的是誰？”
“暫時能算自己人的家夥。”柯南轉回頭，掛斷了電話，再次撥通了另一個手機號碼。
那邊接通以後，柯南沒有打招呼，直接說道：“一會兒聽訊號，就可以撥打電話了。”
電話那頭，安室透看了眼旁邊的風見裕也，打了個響指：“調出全部乘客電話名單，準備好。”
又一扇列車廂門打開，柯南和世良真純已經到了最前麵的商務艙。
世良真純拉開飲料軌跡最後消失的艙門，就看到了裡麵那個行李箱。
兩人打開箱子，把裡麵的阿蘭會長救了出來。
“我這是在哪兒？”阿蘭會長聲音虛弱。
“磁懸浮列車裡。”世良真純找到了人，也鬆出了一口氣。他們順著的軌跡，正是阿蘭會長隨身帶著的功能性飲料打翻流出的水漬。
等柯南通過偵探徽章，告訴了乘坐在新乾線上的所有人，阿蘭會長被綁架到列車上這件事的真相時。
整個新乾線的人，手機都響了起來。
隻有一個人的手機沒響，就是犯人了。
超導磁懸浮列車裡，車廂另一邊，車門打開，宣傳負責人白鳩舞子，站在了車門口。
“因為核磁共振儀的關係，讓電子產品產生了故障，換句話說，引發失超的人，就是你，白鳩舞子小姐。”柯南放下手機和偵探徽章，對著她鄭重說道。