渡輪駛進米花港時，夜色已經籠罩了城市。碼頭邊的路燈亮起暖黃的光，目暮警官帶著幾名警察早已等候在那裡，身邊還停著兩輛警車。看到柯南等人走下渡輪，目暮警官立刻迎了上去：“柯南，夜一，灰原，你們沒事吧？賓加已經被押回警視廳了，我們連夜對他進行審訊，希望能從他嘴裡問出更多黑衣組織的線索。”
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柯南點點頭，從口袋裡掏出手機，調出拍攝的直升機編號和浮標機房的現場照片：“目暮警官，這是貝爾摩德他們乘坐的直升機編號，還有浮標機房的現場證據，或許能幫你們找到組織的藏身之處。”目暮警官接過手機，讓高木涉把資料拷貝下來，“辛苦你們了，這次多虧了你們，才沒讓組織得逞。你們先回去休息，有消息我會第一時間通知你們。”
小蘭擔心地看著灰原：“灰原，你要不要去我家住？晚上一個人在家太危險了。”灰原搖搖頭，笑著說：“沒關係，博士會在家等我，而且我也想儘快整理浮標島的線索，看看能不能找到組織的其他動向。”柯南也說：“小蘭姐姐，你放心吧，我和夜一會送灰原回博士家，不會讓她有事的。”
告彆小蘭和園子後，柯南、夜一和灰原坐上了阿笠博士來接他們的黃色甲殼蟲。車子駛在安靜的街道上，阿笠博士看著後視鏡裡臉色有些蒼白的灰原，心疼地說：“灰原，今天肯定嚇壞了吧？回去我給你做你最喜歡的檸檬派，壓壓驚。”灰原點點頭，輕聲說：“謝謝博士。不過我們現在要做的，是儘快整理賓加的審訊記錄和浮標監控數據，說不定能找到組織要在米花大學附近建秘密實驗室的線索。”
回到阿笠博士家，幾人立刻圍坐在實驗室的桌子旁。阿笠博士打開電腦，把柯南帶來的浮標監控備用數據導了進去，屏幕上立刻顯示出密密麻麻的代碼和地圖。灰原盯著屏幕，手指在鍵盤上快速敲擊：“這些數據裡有很多加密文件，應該是浮標監控係統的核心指令。如果組織拿到這些數據，就能操控全球的警察監控攝像頭，到時候我們的行蹤就會暴露無遺。”
夜一湊過來看了一眼屏幕：“那我們能不能利用這些數據，反向追蹤組織的位置？比如他們之前操控監控攝像頭的痕跡。”阿笠博士搖搖頭：“很難，組織的反追蹤技術很厲害，而且這些數據已經被他們篡改過一部分，很多關鍵信息都被刪除了。不過我可以嘗試恢複被刪除的文件，說不定能找到一些線索。”
柯南坐在一旁，手裡拿著賓加的審訊記錄複印件——上麵寫著賓加的真實身份是前歐警署情報員，他的同伴在德國負責調查黑衣組織的毒藥交易，結果被琴酒發現並殺害。賓加為了報仇，主動聯係朗姆，提出幫組織搶奪浮標技術，條件是讓他親手殺了琴酒。
“原來如此，”柯南皺著眉頭，“賓加隻是被組織利用了，朗姆根本不可能讓他殺了琴酒。等賓加沒有利用價值了，組織肯定會殺了他。”灰原點點頭：“沒錯，組織從來不會留下沒用的人。我們現在要做的，是儘快從賓加嘴裡問出更多組織的秘密，比如朗姆的真實身份，還有秘密實驗室的具體位置。”
就在這時，柯南的手機突然響了，是朱蒂老師打來的。“柯南，”朱蒂的聲音帶著一絲興奮，“我們在德國查到了琴酒殺害歐警署職員的現場，發現了一個加密硬盤，裡麵有組織最近的交易記錄，其中提到了‘米花大學實驗室’和‘r成分’，看來組織已經知道你們要去提取‘r成分’了！”
柯南心裡一沉：“什麼？組織已經知道了？那我們下周去米花大學豈不是很危險？”朱蒂說：“彆擔心，我們已經通知了日本警方和fbi，會在米花大學周邊布置更多的人手。另外，我們還查到，貝爾摩德和波本已經回到了米花市，正在暗中調查米花大學的實驗室位置，你們一定要小心。”
掛了電話，柯南把朱蒂的話告訴了大家。夜一立刻拿出米花大學的地圖，在上麵標記出實驗室的位置和周邊的警力部署：“我們必須調整計劃，提前一天去米花大學，和老教授確認提取儀的使用情況，同時檢查實驗室的安全，看看有沒有組織的人安裝竊聽器或者跟蹤器。”
阿笠博士也說：“我會帶上更多的防身工具，比如煙霧彈、微型麻醉槍，還有信號乾擾器，防止組織的人追蹤我們的信號。另外，我還會準備一個特製的箱子，用來存放提取出來的‘r成分’，箱子裡有定位器和防盜裝置，一旦被搶走，我們就能立刻追蹤到位置。”
灰原看著屏幕上的加密文件，突然說：“我破解了一個文件，裡麵提到了‘朗姆的替身’。看來朗姆不會親自出麵，而是會派一個替身來指揮這次行動，我們要注意分辨，不要被替身迷惑了。”柯南點點頭：“沒錯，朗姆一直很神秘，從來沒有露過真麵目，他很可能會派替身來執行任務，我們一定要小心。”
第二天一早，柯南、夜一和灰原就來到了米花大學，和老教授見麵。老教授是個頭發花白的老人，戴著厚厚的眼鏡，看到他們，笑著說：“我已經把提取儀準備好了，就在實驗室的二樓。不過最近學校裡來了幾個陌生的人，說是來參觀的，但是行為很可疑，你們要注意安全。”
柯南心裡一動：“老教授，你還記得那些人的樣子嗎？有沒有留下聯係方式？”老教授想了想，說：“有一個穿著黑色西裝、留著胡子的男人，說是某家科技公司的代表，想和我合作研發新技術，還留了一張名片。”他從抽屜裡拿出一張名片，遞給柯南——名片上寫著“吉田英夫，xx科技公司總經理”，地址是米花市的一棟寫字樓。
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夜一接過名片，仔細看了看：“這個地址是假的，xx科技公司根本不存在，這個人肯定是組織的人，來打探實驗室的情況。”灰原也說：“我們現在就去實驗室檢查一下，看看有沒有被安裝竊聽器或者跟蹤器。”
三人跟著老教授來到實驗室二樓，實驗室裡擺放著各種先進的儀器，提取儀就放在房間的中央。夜一拿出一個微型探測器，在房間裡仔細掃描，沒過多久，探測器就發出了“滴滴”的警報聲——在提取儀的底部，發現了一個微型竊聽器。
“果然有問題，”柯南皺著眉頭，把竊聽器取下來，“這個竊聽器是最新款的，能實時傳輸聲音，看來組織已經盯上這裡了。我們必須儘快把它交給警方，讓他們分析裡麵的信號，找到組織的監聽位置。”
老教授驚訝地說：“沒想到這些人竟然這麼大膽，敢在學校裡安裝竊聽器！幸好你們發現了，不然我的研究成果就會被他們偷走了。”灰原安慰道：“老教授，彆擔心，我們會保護好實驗室的安全，不會讓組織的人得逞的。”
下午，柯南把竊聽器交給了目暮警官。警方通過分析竊聽器的信號，發現信號來自米花市郊區的一棟廢棄工廠——那裡很可能是組織的臨時據點。目暮警官立刻帶領警察，包圍了廢棄工廠，但是裡麵已經空無一人，隻留下了一些廢棄的儀器和幾張太平洋浮標的圖紙。
“看來他們已經跑了，”高木涉失望地說，“不過我們在工廠裡找到了一些文件，裡麵有米花大學實驗室的詳細地圖和提取‘r成分’的流程，看來組織已經做好了搶奪‘r成分’的準備。”柯南拿起文件，仔細看了看：“這些流程和我們整理的差不多，說明組織已經拿到了蒲田耕平的資料，我們必須加快速度，在組織之前提取到‘r成分’。”
接下來的幾天，柯南等人一直在為提取“r成分”做準備。阿笠博士調試好了提取儀，夜一和警方確認了警力部署，灰原則整理好了蒲田耕平的資料，確保提取流程萬無一失。小蘭也很擔心他們，每天都會給他們打電話，提醒他們注意安全。
終於到了提取“r成分”的日子。一大早，柯南、夜一、灰原和阿笠博士就來到了米花大學。實驗室周圍已經布置了很多警察，有的穿著便衣，有的穿著警服，密切關注著周圍的情況。老教授已經在實驗室裡等著他們，提取儀已經預熱完畢，就等著開始提取。
“我們開始吧，”灰原深吸一口氣，把蒲田耕平的資料放在桌子上，“首先要把植物樣本放進提取儀，然後加入試劑，設置好溫度和時間，等待提取儀完成提取。整個過程大約需要兩個小時，期間不能中斷，否則樣本就會損壞。”
阿笠博士點點頭，把植物樣本放進提取儀，加入試劑，然後按下了啟動鍵。提取儀發出輕微的聲響，屏幕上顯示出提取進度——10、20、30……時間一分一秒地過去，實驗室裡的氣氛越來越緊張，每個人都在留意著周圍的動靜，生怕組織的人突然出現。
就在提取進度達到80的時候，實驗室的門突然被撞開了！幾個穿著黑色西裝的人衝了進來，手裡拿著槍，對著警察大喊：“不許動！把‘r成分’交出來！”為首的是一個留著黑色長發的男人，臉上戴著口罩，眼神冰冷——正是貝爾摩德偽裝的！
“貝爾摩德！”柯南大喊著，拿出足球，用腳踩了踩足球鞋上的開關，足球立刻膨脹起來。夜一也拿出暗器，對著貝爾摩德的手下扔了過去，擊中了一個人的手腕，手槍掉在了地上。
警察立刻衝了上去，和組織的人展開了搏鬥。實驗室裡一片混亂，桌子被推翻，儀器被撞壞，提取儀的屏幕上顯示著提取進度——95、96、97……灰原緊緊盯著屏幕，雙手在鍵盤上快速敲擊，確保提取過程不被中斷。
貝爾摩德看到提取儀馬上就要完成提取，立刻朝著灰原衝了過去：“雪莉，把‘r成分’交出來！不然我就毀了提取儀！”柯南見狀，立刻把足球踢了出去，足球正好擊中貝爾摩德的後背，貝爾摩德摔倒在地上。
“灰原，快！提取完成了！”阿笠博士大喊著，把提取出來的“r成分”裝進特製的箱子裡，鎖上密碼鎖。灰原立刻拿起箱子，跟著柯南和夜一朝著實驗室的後門跑去。
貝爾摩德從地上爬起來，對著手下大喊：“快追！不能讓他們跑了！”她的手下們立刻跟了上去，警察則在後麵緊緊追趕。柯南、夜一和灰原跑出實驗室，坐上了停在門口的黃色甲殼蟲，阿笠博士立刻發動車子，朝著阿笠博士家的方向駛去。
貝爾摩德和她的手下也坐上了黑色的轎車，在後麵緊緊追趕。車子在米花市的街道上飛馳，警笛聲從遠處傳來——目暮警官帶著警察趕來了！貝爾摩德看到警察，隻好放棄追趕，對著手下大喊：“撤！下次再找他們算賬！”黑色的轎車立刻拐進一條小巷，消失在夜色中。
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黃色甲殼蟲駛進阿笠博士家的車庫，幾人立刻下車，跑進實驗室。阿笠博士把裝有“r成分”的箱子放進保險櫃，鎖上密碼鎖，然後鬆了一口氣：“終於安全了！‘r成分’沒有被搶走，我們可以開始研製永久解藥了！”
柯南看著保險櫃，臉上露出了堅定的笑容：“太好了！隻要研製出永久解藥，我就能變回新一，和小蘭一起，過上平靜的生活。而且我們還拿到了組織的很多線索，相信很快就能找到朗姆的真實身份，徹底摧毀黑衣組織！”
夜一也笑著說：“是啊，這次浮標島之行和米花大學提取‘r成分’，雖然遇到了很多危險，但我們都成功克服了。隻要我們繼續努力，團結一心，就沒有克服不了的困難。”
灰原看著大家，嘴角也露出了一絲微笑：“我已經等不及要研製出永久解藥了，我想儘快擺脫‘雪莉’的身份，以灰原哀的名字，和朋友們一起，去看伊豆的五重塔，去浮標島賞鯨，過平靜、幸福的生活。”
阿笠博士拍了拍他們的肩膀，笑著說：“放心吧，我們一定會成功的。明天我們就開始研製永久解藥，相信用不了多久，就能完成。到時候，柯南就能變回新一，灰原也能過上自己想要的生活。”
窗外的月光灑進實驗室，照亮了桌子上的蒲田耕平資料和“r成分”樣本。柯南、夜一、灰原和阿笠博士圍坐在桌子旁，臉上都充滿了希望。他們知道，雖然和黑衣組織的鬥爭還沒有結束，但他們已經邁出了重要的一步，離徹底摧毀組織、過上平靜生活的目標，越來越近了。
與此同時，在黑衣組織的秘密基地裡，朗姆坐在黑暗的房間裡，聽著貝爾摩德的彙報。“朗姆先生，我們沒能搶到‘r成分’，警方和fbi的人太多了，我們沒辦法對抗。”貝爾摩德低著頭，不敢看朗姆的眼睛。
朗姆的聲音低沉而冰冷：“廢物！連一點小事都辦不好！我養你們有什麼用？”他頓了頓，繼續說：“不過沒關係，我們還有機會。工藤新一和雪莉以為拿到‘r成分’就萬事大吉了，他們不知道，我已經在他們身邊安插了眼線，很快就能知道他們的一舉一動。等他們研製出永久解藥，我們再動手，把解藥和他們一起消滅！”
貝爾摩德抬起頭，眼神裡充滿了驚訝：“朗姆先生，您在他們身邊安插了眼線？是誰？”朗姆冷笑一聲：“你不需要知道是誰，你隻要做好自己的事情就行了。儘快找到工藤新一和雪莉的藏身之處，隨時準備行動。”
貝爾摩德點點頭：“是，朗姆先生。我一定會找到他們，不會讓您失望的。”她轉身離開了房間，心裡卻充滿了疑惑——朗姆在柯南他們身邊安插了眼線，到底是誰呢？是小蘭？園子？還是阿笠博士？她不敢想下去，隻能儘快按照朗姆的命令，開始調查柯南他們的行蹤。
而在阿笠博士家的實驗室裡，柯南還不知道危險已經悄悄逼近。他看著桌子上的“r成分”樣本，心裡暗暗發誓：“黑衣組織，我一定會研製出永久解藥，變回新一，保護好小蘭和所有我在乎的人。我不會讓你們的陰謀得逞，一定會徹底摧毀你們，讓米花市恢複平靜！”
夜一和灰原也看著“r成分”樣本，眼神裡充滿了期待。他們知道，雖然前路還有很多危險，但隻要他們團結一心，就沒有克服不了的困難。他們期待著，那一天能早日到來——柯南變回工藤新一，灰原擺脫“雪莉”的身份，他們一起和小蘭、園子、阿笠博士一起，過上平靜、幸福的生活，再也不用被黑衣組織的陰影困擾。
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