庚戌日，李克用率軍返回太原。
二月，王重榮、朱玫、李昌符再次聯名上表，請求誅殺田令孜。
朝廷任命前東都留守鄭從讜為守太傅兼侍中。
朱玫、李昌符指使山南西道節度使石君涉在險要之處設置柵欄，阻斷交通，燒毀驛站，皇帝隻好改走其他道路前進。沿途山穀崎嶇難行，邠寧的軍隊在後麵緊追不舍，皇帝多次陷入危急境地，才勉強抵達山南地區。三月壬午日，石君涉放棄藩鎮，逃奔朱玫。
癸未日，留在鳳翔的百官蕭遘等人列舉田令孜及其黨羽韋昭度的罪狀，請求誅殺他們。當初，韋昭度依靠供奉僧澈攀附宦官，才得以當上宰相。僧澈的師父知玄鄙視僧澈的所作所為，韋昭度每次和同僚前往拜見知玄時，都向他行跪拜禮，知玄卻隻是拱手作揖，讓他們到僧澈那裡去喝茶。
山南西道監軍、馮翊人嚴遵美在西縣迎接皇帝，丙申日，皇帝的車駕抵達興元。
戊戌日，朝廷任命禦史大夫孔緯、翰林學士承旨、兵部尚書杜讓能同為兵部侍郎、同平章事。
保鑾都將李鋋等人在鳳州擊敗邠寧軍隊。
朝廷下詔加封王重榮為應接糧料使，命他調撥本道十五萬斛糧食來供給國家使用。王重榮上表聲稱，隻要田令孜沒有被誅殺，他就不奉詔行事。
朝廷任命尚書左丞盧渥為戶部尚書，兼任山南西道留後；任命嚴遵美為內樞密使。派遣王建率領部下士兵戍守三泉，晉暉以及神策軍使張造率領四都的士兵屯駐黑水，搶修棧道以打通往來通道。任命王建遙領壁州刺史。將帥遙領州鎮的慣例，就是從這時開始的。
陳敬瑄猜忌東川節度使高仁厚，想要除掉他。遂州刺史鄭君立起兵攻陷漢州，率軍向成都進軍。陳敬瑄派遣部將李順之前去迎戰，鄭君立兵敗被殺。陳敬瑄又調發維州、茂州的羌族軍隊攻打高仁厚，將他殺死。
朱玫認為田令孜一直在皇帝身邊，終究難以鏟除，就對蕭遘說：“皇帝流亡遷徙已經六年了，中原地區的將士們冒著槍林彈雨衝鋒陷陣，百姓們供應糧草物資，戰死餓死的人多達十分之七八，才勉強收複京城。天下人正滿心歡喜地期盼皇帝返回宮中，皇帝卻把平定叛亂的功勞都歸於宦官，把朝廷大權交給他們，致使朝綱法紀敗壞，藩鎮受到騷擾，最終招來禍亂。我前些天奉命前來迎接皇帝車駕，不僅沒有得到信任和理解，反而被誣陷為脅迫君主。我們報效國家的忠心已經儘到了，討伐叛賊的力量也已經用儘了，怎麼能低頭帖耳，任由宦官擺布呢！大唐皇室的子孫還有很多，宰相您為何不另做打算，為國家謀求利益呢？”蕭遘說：“皇帝登基已經十多年了，沒有犯下什麼大的過錯。隻是因為田令孜在皇帝身邊獨攬大權，才導致皇帝連安穩覺都睡不好，皇帝每次提起這件事，都痛哭流涕。最近皇帝本來沒有出行的打算，是田令孜在宮中陳列軍隊，逼迫皇帝動身，連等到天亮都不肯。所有的罪過都在田令孜身上，天下人誰不知道！您對王室儘心儘力，正應該率領軍隊返回藩鎮，上表迎接皇帝回京。廢黜和擁立皇帝是國家的頭等大事，即便是伊尹、霍光那樣的權臣都感到為難，我不敢聽從您的命令！”朱玫退出後，公開宣布說：“我要擁立大唐李氏的一位親王為皇帝，誰敢有異議，一律斬首！”
夏季四月壬子日，朱玫逼迫留在鳳翔的百官擁立襄王李煴暫代軍國大事，秉承皇帝旨意任命官員、指揮調度，同時派遣大臣前往蜀地迎接皇帝車駕，在石鼻驛與百官盟誓。朱玫讓蕭遘撰寫冊封李煴的文書，蕭遘推辭說自己思路枯竭、文筆生疏；朱玫於是讓兵部侍郎、判戶部鄭昌圖來撰寫。乙卯日，李煴接受冊封，朱玫自任左、右神策十軍使，率領百官向李煴行朝拜禮，任命鄭昌圖為同平章事、判度支、鹽鐵、戶部，分彆設置副使，將三司的事務全部委托給他。留在河中府的百官崔安潛等人向襄王李煴獻上奏箋，恭賀他接受冊封。
田令孜自知不為天下人所容，於是舉薦樞密使楊複恭為左神策中尉、觀軍容使，自己則請求擔任西川監軍使，前往成都依附陳敬瑄。楊複恭上台後，排斥田令孜的黨羽，把王建貶為利州刺史，晉暉貶為集州刺史，張造貶為萬州刺史，李師泰貶為忠州刺史。
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五月，朱玫任命中書侍郎、同平章事蕭遘為太子太保，自己加任侍中、諸道鹽鐵、轉運等使；加封裴澈判度支，鄭昌圖判戶部；任命淮南節度使高駢兼任中書令，充任江、淮鹽鐵、轉運等使、諸道行營兵馬都統；任命淮南右都押牙、和州刺史呂用之為嶺南東道節度使。朱玫大肆封官許願，以此取悅各地藩鎮。他派遣吏部侍郎夏侯潭到河北地區安撫宣諭，戶部侍郎楊陟到江淮地區安撫宣諭，各地藩鎮接受他任命的占了十分之六七，高駢還獻上奏箋，勸說李煴正式登基稱帝。
呂用之設立官府、開幕治事，排場和高駢完全一樣；凡是高駢的心腹，以及有才乾能夠勝任職務的將領官吏，呂用之都逼迫他們順從自己，各種所作所為，不再向高駢請示稟報。高駢對此頗為懷疑，暗中想要奪回權力，但呂用之的根基已經穩固，高駢對他無可奈何。呂用之察覺到高駢的心思，十分恐懼，前去拜訪他的黨羽、前度支巡官鄭杞和前知廬州事董瑾，鄭杞說：“現在才想到要動手，實在是太晚了！”呂用之向他詢問對策，鄭杞說：“曹孟德有句話說得好：‘寧肯我辜負彆人，不能讓彆人辜負我。’”第二天，鄭杞和董瑾一起寫了一封密信交給呂用之，信中的內容極為隱秘，沒有人知道其中的詳情。
蕭遘聲稱身患疾病，辭官返回永樂縣。
當初，鳳翔節度使李昌符與朱玫合謀擁立襄王李煴，後來朱玫自任宰相獨攬大權，李昌符十分惱怒，拒不接受朱玫任命的官職，轉而向興元的皇帝呈遞奏表。朝廷下詔加封李昌符為檢校司徒。朱玫派遣部將王行瑜率領邠寧、河西的五萬軍隊追擊皇帝的車駕，感義節度使楊晟接連戰敗，放棄散關逃走，王行瑜率軍進屯鳳州。
這時，各地上繳朝廷的賦稅貢品大多運往長安，而不是興元，跟隨皇帝的官員和侍衛士兵都缺乏糧食，皇帝痛哭流涕，不知該如何是好。杜讓能對皇帝說：“楊複光和王重榮聯手擊敗黃巢，收複京城，兩人關係向來親厚和睦；楊複恭是楊複光的兄長。如果派遣朝中重臣前往王重榮那裡，向他闡明大義，再加上楊複恭從中斡旋，王重榮一定會奉詔行事。”皇帝於是派遣右諫議大夫劉崇望出使河中，攜帶詔書曉諭王重榮。王重榮奉命之後，派遣使者獻上十萬匹絹布，並且請求討伐朱玫，以此贖罪。
戊戌日，襄王李煴派遣使者前往晉陽，賜給李克用詔書，詔書中說：“皇帝行至半路，禁軍發生兵變作亂，皇帝倉促之間不幸駕崩。我被各地藩鎮推舉擁戴，如今已經接受冊封。”朱玫也寫信給李克用。李克用得知擁立李煴的陰謀都是朱玫一手策劃的，勃然大怒。大將蓋寓勸說李克用道：“皇帝流亡遷徙，天下人都把罪責歸咎於您。現在如果不誅殺朱玫，廢黜李煴，您就沒有辦法洗刷自己的冤屈。”李克用聽從了他的建議，燒毀了詔書，囚禁了使者，向鄰近的藩鎮發布檄文，聲稱：“朱玫竟敢欺騙各地藩鎮，謊稱皇帝已經駕崩。我已經調發蕃、漢士兵三萬人，進軍討伐叛逆之賊，希望各藩鎮能和我一起齊心協力，共建大功。”蓋寓是蔚州人。
秦賢率軍進犯宋州、汴州，朱全忠在尉氏南麵擊敗了他；癸巳日，朱全忠派遣都將郭言率領步兵、騎兵三萬人攻打蔡州。
六月，朝廷任命扈蹕都將楊守亮為金商節度使、京畿製置使，率領兩萬士兵從金州出兵，與王重榮、李克用聯手討伐朱玫。楊守亮原本姓訾，名叫訾亮，是曹州人，他和弟弟訾信都是楊複光的養子，才改名為楊守亮、楊守信。
李克用派遣使者獻上奏表，聲稱：“我正調發軍隊渡過黃河，鏟除叛逆黨羽，迎接皇帝車駕，懇請陛下下詔，命各道藩鎮與我協同作戰。”在此之前，山南地區的百姓都傳言李克用與朱玫勾結，人心惶惶；李克用的奏表送到後，皇帝拿出來給跟隨的官員們看，並且曉諭山南地區的各個藩鎮，人心這才安定下來。然而李克用的奏表中仍然提及要討伐朱全忠，皇帝讓楊複恭寫信曉諭李克用說：“等到京城周圍地區的局勢平定之後，再對你討伐朱全忠的事做出安排。”
衡州刺史周嶽發兵攻打潭州，欽化節度使閔勖招來淮西將領黃皓進入城中共同防守，黃皓卻趁機殺死了閔勖。周嶽率軍攻克潭州城，生擒黃皓，將他斬首。
鎮海節度使周寶派遣牙將丁從實襲擊常州，趕走張鬱。張鬱逃奔海陵，投靠鎮遏使、南昌人高霸。高霸原本是高駢的部將，鎮守海陵，擁有百姓五萬戶，士兵三萬人。
秋季七月，秦宗權攻陷許州，殺死節度使鹿晏弘。
王行瑜率軍進攻興州，感義節度使楊晟放棄藩鎮逃走，占據文州。朝廷下詔命保鑾都將李鋋、扈蹕都將李茂貞、陳佩率軍屯駐大唐峰，抵禦王行瑜。李茂貞是博野人，原本姓宋，名叫文通，因立下戰功被皇帝賜姓名為李茂貞。
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朝廷下令將欽化軍改名為武安軍，任命衡州刺史周嶽為節度使。
八月，盧龍節度使李忠去世，朝廷任命他的兒子李匡威為留後。
王潮率軍攻克泉州，殺死刺史廖彥若。王潮聽說福建觀察使陳岩威名遠揚，不敢進犯福州地界，派遣使者向陳岩投降，陳岩上表推薦王潮為泉州刺史。王潮沉穩勇猛，富有智謀韜略，占據泉州之後，招撫流亡離散的百姓，平均賦稅，修繕兵器，官吏和百姓都心悅誠服。王潮把王緒幽禁在彆處的館舍中，王緒感到羞慚，自殺身亡。
九月，朱玫的部將張行實率軍攻打大唐峰，李鋋等人將他擊退。金吾將軍滿存與邠寧軍隊交戰，擊敗敵軍，重新奪回興州，率軍進駐萬仞寨堅守。
李克修率軍攻打孟方立，甲午日，在焦岡生擒孟方立的部將呂臻，攻克故鎮、武安、臨洺、邯鄲、沙河等地，任命大將安金俊為邢州刺史。
留在長安的百官，以太子太師裴璩為首，向襄王李煴上書勸進。冬季十月，李煴正式登基稱帝，改年號為建貞，遙尊身在興元的皇帝為太上元皇帝。
董昌對錢鏐說：“你如果能攻取越州，我就把杭州的軍政大權交給你。”錢鏐回答：“好，不拿下越州，終究會成為後患。”於是錢鏐率領軍隊從諸暨出發，直奔平水，開山辟路五百裡，抵達曹娥埭，浙東將領鮑君福率領部眾向他投降。錢鏐率軍與浙東軍隊交戰，屢次取勝，進軍屯駐在豐山。
感化軍牙將張雄、馮弘鐸得罪了節度使時溥，聚集三百名部眾，出逃渡過長江，突襲蘇州並占據該城。張雄自稱蘇州刺史，逐漸招兵買馬，兵力擴充到五萬人，戰船一千多艘，自號天成軍。
河陽節度使諸葛爽去世，大將劉經、張全義擁立諸葛爽的兒子諸葛仲方為留後。張全義是臨濮人。
李克修率軍攻打邢州，沒能攻克，隻好撤軍返回。
十一月丙戌日，錢鏐攻克越州，浙東觀察使劉漢宏逃奔台州。
義成節度使安師儒把軍政大權委托給兩廂都虞候夏侯晏、杜標，這兩人驕橫放縱，軍中將士都心懷怨恨。小校張驍暗中逃出軍營，聚集兩千部眾攻打州城，安師儒斬殺夏侯晏、杜標二人，將他們的首級示眾，軍中的騷動才稍稍平息。天平節度使朱瑄圖謀奪取滑州，派遣濮州刺史朱裕率軍引誘張驍，將其斬殺。朱全忠搶先派遣部將朱珍、李唐賓襲擊滑州，軍隊進入義成地界時，遭遇大雪。朱珍等人率領部下連夜疾馳到滑州城下，架起上百架雲梯同時攻城，最終攻克滑州，俘虜安師儒，將其押回汴州。朱全忠任命牙將、江陵人胡真擔任義成留後。
田令孜抵達成都後，請求允許自己尋訪名醫治病，朝廷批準了他的請求。
十二月戊寅日，各路官軍攻克鳳州，朝廷任命滿存為鳳州防禦使。
楊複恭向關中地區傳布檄文，宣稱：“凡是能獻上朱玫首級的人，就任命他為靜難節度使。”王行瑜接連戰敗，擔心被朱玫治罪，便和部下商議說：“如今我們作戰無功，回去也是死路一條；不如和你們一起斬殺朱玫的首級，平定京城，迎接皇帝車駕回京，奪取邠寧節度使的符節和斧鉞！”部眾都表示讚同。甲寅日，王行瑜擅自率領軍隊從鳳州返回京城長安，朱玫正在處理政務，聽說此事後勃然大怒，召見王行瑜，斥責他說：“你擅自率軍返回，是想謀反嗎？”王行瑜回答：“我不是謀反，是要誅殺謀反的逆賊朱玫！”於是下令擒殺朱玫，連同他的黨羽幾百人一同處死。官軍各部頓時陷入大亂，在京城內燒殺搶掠，百姓們沒有衣服禦寒，凍死的人遍布街巷。裴澈、鄭昌圖率領兩百多名百官，侍奉襄王李煴逃奔河中，王重榮假意出城迎接，將李煴擒獲斬殺，囚禁了裴澈、鄭昌圖；百官中遇難的人幾乎達到半數。
台州刺史杜雄引誘劉漢宏前來，將他擒獲後押送給董昌，董昌下令將劉漢宏斬首。董昌於是將治所遷到越州，自稱代理浙東軍府事務，任命錢鏐主持杭州軍政事務。
王重榮將襄王李煴的首級裝在匣子中，送往皇帝所在的興元行宮。刑部請求皇帝親臨興元城南門舉行獻俘儀式，百官一同入朝慶賀。太常博士殷盈孫上奏提出異議，認為：“李煴是被叛賊逼迫才登基稱帝的，他的罪過不過是沒能為朝廷守節而死。按照禮製，皇室宗親犯下死罪，君主應當身穿素服，停止舉辦宴會以示哀悼。如今李煴已經被誅殺，應當將他廢為平民，命令當地官府埋葬他的首級。至於獻俘慶賀的典禮，請等朱玫的首級送到後再舉行。”朝廷采納了他的建議。殷盈孫是殷侑的孫子。
河陽大將劉經畏懼李罕之難以控製，親自率領軍隊鎮守洛陽，在澠池突襲李罕之，反被李罕之擊敗，劉經放棄洛陽逃走，李罕之率軍追擊，幾乎將劉經的部眾斬儘殺絕。李罕之率軍屯駐在鞏縣，準備渡過黃河，劉經派遣張全義率軍抵禦。當時諸葛仲方年幼勢弱，軍政大權都掌握在劉經手中，將領們大多不肯歸附。於是張全義與李罕之聯手，合兵攻打河陽，被劉經擊敗，李罕之、張全義隻好率軍撤退，固守懷州。
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當初，忠武軍決勝指揮使孫儒與龍驤指揮使、朗山人劉建鋒一同戍守蔡州，抵禦黃巢。扶溝人馬殷隸屬軍中，憑借勇武多才聞名。等到秦宗權叛亂時，孫儒等人都歸附了他。秦宗權派遣孫儒率軍攻陷鄭州，鄭州刺史李璠逃奔大梁。孫儒又進軍攻陷河陽，河陽留後諸葛仲方也逃奔大梁。孫儒自稱河陽節度使，張全義占據懷州，李罕之占據澤州，以抵禦孫儒的進攻。當初，長安人張佶擔任宣州幕僚，因厭惡觀察使秦彥的為人，辭官離去。路過蔡州時，秦宗權將他留下，任命為行軍司馬。張佶對劉建鋒說：“秦宗權剛愎凶狠又生性猜忌，滅亡是遲早的事，我們這些人該如何保全自身呢！”劉建鋒正為自己的處境感到擔憂，於是和張佶結交，關係日益密切。
壽州刺史張翱派遣部將魏虔率領一萬軍隊進犯廬州，廬州刺史楊行湣派遣部將田頵、李神福、張訓率軍抵禦，在褚城擊敗魏虔。滁州刺史許勍率軍襲擊舒州，舒州刺史陶雅逃奔廬州。高駢下令讓楊行湣改名為楊行密。
這一年，天平軍牙將朱瑾趕走泰寧節度使齊克讓，自稱泰寧留後。朱瑾當初準備襲擊兗州時，先向齊克讓請求聯姻，然後從鄆州出發，整治車馬服飾，外表裝扮得十分華麗，暗中卻暗藏兵器鎧甲，前往兗州。在親迎的當晚，朱瑾預先埋伏的士兵突然發動襲擊，趕走齊克讓，取而代之。朝廷隻好順勢任命朱瑾為泰寧節度使。
安陸賊寇首領周通率軍攻打鄂州，鄂州刺史路審中棄城逃走。嶽州刺史杜洪趁機率軍進入鄂州，自稱武昌留後，朝廷於是正式任命他擔任這一職務。湘陰賊寇首領鄧進思又乘虛攻陷嶽州。
秦宗言率軍圍攻荊南長達兩年之久，張瑰環城固守。城中一鬥米的價格漲到四十緡，連鎧甲、戰鼓都被煮來吃了，士兵們隻好敲擊門板報時警戒，城中餓死的人隨處可見，屍體堆積如山。秦宗言最終還是沒能攻克荊南，隻好撤軍離去。
光啟三年丁未公元887年）
春季正月，朝廷任命邠州都將王行瑜為靜難軍節度使，扈蹕都頭李茂貞兼任武定節度使，扈蹕都頭楊守宗為金商節度使，右衛大將軍顧彥朗為東川節度使，金商節度使楊守亮為山南西道節度使。顧彥朗是豐縣人。
辛巳日，朝廷任命董昌為浙東觀察使，錢鏐為杭州刺史。
秦宗權自認為兵力是朱全忠的十倍，卻屢次被朱全忠擊敗，深感恥辱，打算集中全部兵力攻打汴州。朱全忠擔心自己兵力不足，二月，任命諸軍都指揮使朱珍為淄州刺史，派他前往東道招募士兵，約定初夏時節返回。
戊辰日，朝廷下令削奪三川都監田令孜的官爵，將他長期流放端州。但田令孜依附陳敬瑄，最終並沒有前往流放地。
代北節度使李國昌去世。
三月癸未日，朝廷下詔，命令在當地集結部眾，將偽宰相蕭遘、鄭昌圖、裴澈斬首，三人最終都死在岐山。當時接受李煴任命的朝官數量眾多，司法部門原本打算將他們全部處以極刑。杜讓能竭力爭辯，為他們求情，最終得以幸免的人達到十分之七八。
壬辰日，皇帝的車駕抵達鳳翔，節度使李昌符擔心皇帝返回京城後，雖然不會追究自己之前的過錯，但對自己的恩寵和賞賜一定會減少，於是以皇宮尚未修繕完畢為借口，堅決請求皇帝留在鳳翔府的官舍中，皇帝依從了他的請求。
太傅兼侍中鄭從讜被罷免官職，改任太子太保。
鎮海節度使周寶招募一千名親軍，號稱後樓兵，供給的糧餉是鎮海軍的兩倍，鎮海軍的士兵都心懷怨恨，而後樓兵則日益驕橫，難以控製。周寶沉溺於聲色犬馬，不親自處理政務，還征發民夫修築二十多裡的外城，建造豪華的府第，百姓都為繁重的徭役所苦。周寶和下屬官員在後樓宴飲，有人提及鎮海軍士兵心懷不滿，周寶說：“敢作亂就殺掉他們！”度支催勘使薛朗把周寶的話告訴了與自己交好的鎮海軍將領劉浩，告誡他約束好部下士兵，劉浩說：“隻有造反才能免於一死啊！”當天夜裡，周寶喝醉後正在睡覺，劉浩率領同黨發動叛亂，攻打節度使府舍並放火焚燒。周寶驚慌失措地起身，光著腳跑去敲擊芙蓉門，呼喊後樓兵前來救援，不料後樓兵也一同叛亂了。周寶隻好率領家人徒步逃出青陽門，逃奔常州，前去依附常州刺史丁從實。劉浩下令斬殺節度使府的眾多僚佐，癸巳日，迎接薛朗進入節度使府，推舉他為鎮海留後。周寶此前還兼任租庸副使，府庫中堆積的財物數不勝數，在這一天全部落入亂兵手中。高駢聽說周寶兵敗的消息後，排列儀仗，接受部下的慶賀，還派遣使者送給周寶一包齏粉羞辱他。周寶勃然大怒，將齏粉扔在地上，說：“你身邊有呂用之這樣的人，日後的下場還不知道會怎麼樣呢！”揚州接連幾年發生饑荒，城中每天餓死的人多達幾千，街巷一片蕭條冷落，還屢次出現怪異的現象，高駢卻認為這些災禍都是周寶帶來的。
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