17年前的始源星廢墟，年幼的夜影蜷縮在初代守護者破碎的戰甲旁。銀河議會的雷澤小隊突然出現，為首的銀發指揮官舉起粒子槍對準孩子，卻在扣動扳機前被神秘力量震飛。記憶畫麵劇烈扭曲，知夏看到夜影脖頸後的深淵印記與宇宙之心產生共鳴——原來初代守護者臨終前將宇宙之心的封印密鑰，以基因編碼的形式注入了親生孩子體內。
現實中，夜影在劇痛中蘇醒，發現自己能感知深淵能量的流動軌跡。更可怕的是，機械神靈的核心碎片竟在世界樹根部重組，進化出能吸收深淵之力的新形態。知夏的戒指與碎片產生量子糾纏，在她視網膜上投射出倒計時：72小時後，重組完成的機械生命體將吞噬整個星域。
為尋找對抗機械生命體的方法，兩人重返旋律星域。曾被解救的天籟之魂們聚集在星雲裂隙處，用歌聲構建出通往「音波維度」的通道。知夏在維度深處發現初代守護者遺留的星幻法典，其中記載著能將深淵能量轉化為淨化之力的「逆熵詠歎調」。
但法典需要特定音軌激活，線索指向暗影城堡的禁音室。當他們再次潛入城堡時，發現被摧毀的音波吞噬者殘骸正在變異，無數細小的聲波觸手將整個城堡改造成活體樂器。夜影主動與變異體建立共鳴，在意識海洋中與吞噬者的殘留意識對話，得知其核心藏著能乾擾機械生命體的「混沌頻率」。
決戰在城堡尖塔爆發，知夏吟唱逆熵詠歎調，夜影操控混沌頻率擾亂機械生命體的重組程序。但深淵戒指突然失控，將知夏拽入量子態的「深淵中轉站」。在那裡，她遇見了暗蝕知夏的殘影——原來每一枚深淵戒指都是平行宇宙的錨點，而此刻所有錨點正在同步坍縮。
銀河議會的星際要塞突然出現在始源星軌道，雷澤站在指揮艦的全息投影中冷笑。他展示出捕獲的世界樹幼苗，要挾知夏交出宇宙之心：初代守護者背叛議會的證據就在這株幼苗裡，他們早就知道深淵與宇宙之心同源！
夜影的記憶徹底解封，想起父親臨終前的囑托：宇宙之心本質是維持多元宇宙平衡的「熵增控製器」，而深淵是其失控產生的副作用。此刻機械生命體已進化成跨維度存在，開始吞噬時空本身。知夏的戒指與宇宙之心產生排斥反應，浮現出血色警示：融合兩者將重啟宇宙，分離則導致所有平行宇宙湮滅。
在時空裂縫即將吞沒始源星的瞬間，知夏做出驚人決定——將自己作為容器，強行融合宇宙之心與深淵之力。夜影發動深淵共鳴體能力，用聲波構建穩定場域。兩人的意識在能量風暴中交融，看到了所有平行宇宙的命運線：雷澤其實是初代守護者安排的棋子，他的背叛也是計劃的一部分；而機械神靈的蘇醒，竟是為了篩選出能承受終極力量的「宇宙調和者」。
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