冷庫之中的血液和乾細胞很快被注入碇真嗣的體內，隨後醫生們化驗的過程中就發現，這些剛剛注入到他體內的細胞也開始了基因崩潰，不過區彆在於這些細胞基因崩潰之後，那些碎裂的基因片段又重新排列。
通過分子生物學技術進行分析，其中有大量的未表達的基因片段，大量的人類基因組中未知的序列，在這個過程中表達了出來，重新完成了排列組合後的細胞似乎變得更加強大，但看上去依舊無法挽回整個身體走向崩潰的結局。
就在這時，藍諾在現場提出了自己的建議“你們可以嘗試把他送進插入栓，送回初號機裡麵，你們或許無法感受到，但在我的感應之中，正是一股微弱的at力場，維持著他的生命，沒有崩潰。
現在儘快將初號機修複，讓他回到駕駛艙中，at力場或許能夠幫他扭轉現在的死亡進程。”這個建議雖然天馬行空，但聽起來的確有一定的可行性，而且現在醫生們是真正物理意義上的死馬當成活馬醫。也不得不同意這個建議。
一時之間，碇真嗣飛快從醫院之中轉移了出去，轉移到了正在修複的初號機旁，此時的初號機看起來無比的淒慘，渾身上下纏滿了繃帶，繃帶之上還能看到鮮血的顏色。
一雙沒有眼皮的眼睛裸露出來，看起來相當的滲人，但隨著碇真嗣的靠近，的確有一股無形的力場籠罩在了他的身上。
甚至於不需要進入插入栓，都沒有進入到初號機的內部，醫護人員們就發現自己已經無法靠近碇真嗣了，化驗所需要用到的注射器在接近他的時候，頓時就被一層六邊形的金色光膜阻擋住，這玩意兒連核彈都炸不壞，就更不要說注射器的針頭了。
負責搶救的醫護人員，懵逼的看著，在這一層光膜的籠罩之下，原本已經陷入昏迷的初號機駕駛員手指竟然動了動，而距離他比較近的人則能夠聽到，來自他口中的呢喃“媽”
毫無疑問，這時候出手的正是初號機之中，碇真嗣母親的靈魂，藍諾同樣有辦法緩解碇真嗣反噬的症狀，但他現在的身份如果展現出了一些不合常理的力量，總還是會引發懷疑的，而眼前的這種是最簡單也最不會引起懷疑的方法。
碇真嗣如同是從噩夢之中驚覺一般，某人之間從病床之上坐了起來，眼角還有淚水流淌下來，他覺得自己剛剛好像做了一個夢，夢到母親又一次離開了自己，而醒來的時候，就發現自己躺在病床之上，麵前正是浸泡在鮮紅色液體中的初號機，而他剛好與初號機那滲人的雙目對視。
碇源堂自始至終沒有出麵來看看自己孩子的狀況，此時也不過是站在指揮大廳的高台上，居高臨下的看著初號機和初號機旁邊的病床，而他的臉色則並不是很好看。
藍諾朝上麵瞄了一眼，大概能夠猜到這位碇司令心情為什麼不好，估摸著他去找初號機談心的時候，裡麵老婆的靈魂，屌都不屌他一下，而他兒子稍微出了點事兒，初號機就殷勤的不得了，甚至連at力場都主動隔空釋放出來了，可沒聽說過eva能夠在沒有駕駛員的情況下使用at力場的。
這麼明顯的偏心，顯然是讓這位老婆控司令吃醋了，至少藍諾是這麼猜測的。
如今的碇源堂，已經戴上了手套，名義上說是因為他之前在搶救綾波麗的時候，手心被燙傷了。但實際上他的手套則是為了遮擋移植在他手掌中心的亞當胚胎。
不過似乎是因為計劃的順利推進，碇源堂和碇真嗣之間的關係略微緩和了一些，在這次戰鬥的損失清點完畢後，兩人乘坐直升機來到了一片布滿了金屬樁的荒原。
從天空上看去，那是一幕無比壯觀的場景，數座山峰和中間的峽穀全都光禿禿的一片，沒有一顆植物，取代這些植物的是一根根漆黑的金屬圓柱，一米多高的金屬圓柱整齊的排列在地麵之上，彼此之間相距大約一米，占據了一整片荒原，從天空上看去，甚至讓人產生密集恐懼症一般的感覺。
而隨著直升機落下，隨著靠近了那些金屬圓柱，才能夠看得清那些金屬圓柱上刻著的是一個個人的名字，在一些圓柱的附近，還能看到有人留下的花束。
這是一片墓地，隻不過是一片前所未有巨大的墓地，而利於埋葬的則全都是第二次衝擊以來犧牲的人類。
在這之中，就有碇唯也就是碇真嗣母親的墓碑，和其他人沒什麼區彆，同樣是一根漆黑的金屬圓柱，上麵凋刻著她的名字。
兩人這次來到這裡，正式來給妻子和母親掃墓，雖然沒有什麼交談，但彼此之間似乎有了某種默契，各自都看著墓碑，若有所思。
兩個人都知道，碇唯其實並沒有徹底死去，碇源堂或許並不知道自己的兒子知道這一點，但碇真嗣卻基本可以肯定自家老爸是知道母親的靈魂被困在初號機裡的。
碇真嗣看著墓碑不由得回想起之前的戰鬥之，在自己最痛苦的時候，仿佛有什麼人從背後擁抱了自己，在戰鬥結束的痛苦之中也是同樣，那種熟悉的仿佛是母親一般的感覺，讓他更加堅信自己之前的結論，隻是他並不知道第二次的擁抱其實是來自綾波麗的，不過從某種層麵上來講，說是他媽擁抱的，也沒多大毛病，隻不過一個是靈魂擁抱的，一個是身體擁抱的。
又是使徒來襲間隔之中短暫的平靜，隻不過這一次的平靜持續的時間出乎預料的有些長，已經有兩個月沒有使徒來襲了，碇真嗣在這段時間裡，不斷的研究怎麼突破三賢人係統在網絡層麵的封鎖，同時也有些疑惑為什麼這麼長時間還沒有使徒出現。
其實原因也很簡單，雷米爾還沒死呢，至少還沒從這個世界上消失，藍諾們給人家活捉了，以至於剩下幾個使徒現在相當於卡bug了，自然一時半會兒是出不來的，而藍諾們對於雷米爾的研究也或多或少的取得了一定進展。
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