朱載坖召集這些道士們的原因很簡單，就是希望在文思院成立一個新的部門，專門研究研究物質的組成、結構、性質、變化及其應用，朱載坖將其稱之為化學，而在大明，那些人對於這些最感興趣呢？顯然是這些精於煉丹的道士了，朱載坖希望各個教派能夠選拔推薦這些人才，到大明文思院中任職。
得知朱載坖不是要召集這些道士來煉丹，一眾臣子們都鬆了一口氣，他們最擔心的就是朱載坖重蹈嘉靖的覆轍，篤信煉丹之術，大明才剛剛走上正軌，有了幾分盛世的模樣，要是因為沉迷虛無縹緲的所謂修仙煉丹，再次導致大明政務混亂，是這些臣子們所不願意看到的。
但是一些臣子們仍舊對此有些擔心，原因很簡單，就是朱載坖畢竟在招募了大量的精通煉丹的道士在一起，萬一朱載坖搞明修棧道暗度陳倉怎麼辦？對於這個想法朱載坖也予以了回應，對於官員們這個想法，朱載坖予以了駁斥，朱載坖解釋了此事，他在文思院下設化學研究院，是為了窮究變化之理，也就是格物致知，隻不過他們所格的物是事物變化的原理罷了。
朱載坖還給化學研究院擬定了相關的章程，按照朱載坖的想法，對於現在的化學研究院來說，最為重要的就是改善官軍火藥的性能，提高官軍火藥的威力，還要就是引火藥的研究，官軍要想從前裝槍進化到後裝槍炮，就必須實現彈藥的定裝，而彈藥的定裝除了定裝彈殼之外，最為重要的就是引火藥了，要是能夠有可靠的引火藥，大明的火器威力將會得到極大的提升。
朱載坖明確表示，化學所研究的，都是乾係到國計民生的大事，是能夠影響天下興亡的要害，絕對不是煉丹這樣的虛無縹緲之術可以比擬的，而且重要的不是現象，而是窮究其理，搞清楚背後的原理，這才是化學研究院存在的目的，也是朱載坖要召集這些精於煉丹的道士們的目的。
因為他們常年煉丹，所見所聞必然不少，而且他們大多有一定的文化，能夠將自己所發現的形成文字，編成書籍，傳之後世，這才是朱載坖所看重的，朱載坖希望通過他們，在大明發展起化學和化學工業來，使得大明能夠保證對西洋的技術優勢，這才是朱載坖所心心念念的事情，一時的船堅炮利是很容易做到的，但是要想長久的領先，就必須有基礎科學作為支撐才行。
對於朱載坖所提出的這個問題，一眾道士們開始思考了，朱載坖開出了條件是很優厚的，加入文思院的道士，都授予翰林待詔之職，給七品服色和俸祿，有貢獻，還要予以升賞，同時為了刺激這些道士們的研究熱情，朱載坖還提議，有內帑出銀，刊刻文思院研究成果的書籍，重新編撰道教相關的書籍，由朝廷負責出版發行。
這些道士也是人，也有功名利祿之心，之前他們為什麼沉迷於修仙煉丹，因為上有所好，下必從焉，嘉靖喜好煉丹修仙，這些道士們也希圖通過這個途徑好謀取高官厚祿，所以才會有這麼多人從事這個，而現在朱載坖仍舊是利用他們的功名利祿之心，讓他們為大明出力。
朱載坖說道：“諸位，本朝自太祖高皇帝以來，對道門可謂不薄吧？”
這點倒是不假，太祖對道教的尊崇，一是在於對正一道的崇尚，二是在於太祖將國家祭祀交由道士管理。對於天師，太祖皇帝是極為尊崇的，曾經親自下旨給當時的小天師：“正一嗣教大真人張宇初，書秘訣奧，在續傳不息也。其運玄元之真，而驅萬靈如影響則用已之際神以契符訣之，妙則續傳不息之道，豈不倏哉而感應也?欲否若是，雖善秘書精指訣，雖萬千之熟，亦何應哉?且爾祖至今繼世名世者，以其禦災扞患也。爾正幼年，當節修節潔，精魂思與神通，有時則當用之際神，必爾赴。”
從太祖以後的曆代皇帝，對於道教的態度也都是加以扶持的，曆代天師都是與大明的勳臣甚至是皇親聯姻的，如憲宗時，錫燕內庭，聘成國公朱儀女為配，仍賜蟒衣玉帶，誥授正一嗣教保和養素繼祖守道大真人，領道教事，世宗時天師府與定國公府聯姻，到了本朝，依舊是如此。
當代天師張國祥，娶的是駙馬都尉謝詔的孫女，駙馬都尉謝詔娶的是世宗之妹永淳公主，也就是說，他娶的是朱載坖的表侄女，真要算起來，還真是和天家沾親帶故的。所以在這種情況之下，朱載坖要這些道士們出力，還算不上什麼過分的事情。
張國祥首先出來說道：“陛下既有所命，臣等敢不奉詔！”
有了張天師的帶頭，各門各派也都表示願意出力，朱載坖當即大喜，任命張國祥為文思院副使，負責化學研究院，在鄭王世子朱載堉領導下開展研究，鑒於化學的特殊性，不僅在京師城內有場所，在城外僻靜處也要有實驗場所，同時派遣錦衣親軍加以保護，至於所需的銀兩，直接由內帑撥出。
對於率先響應朱載坖的張國祥，朱載坖也厚加賞賜，賜常服公爵朝祭服、加封正一嗣教大真人、太子少保，朱載坖給化學研究院的第一個任務就是有關於火藥的，經過大量的實戰，火銃和火炮已經成為大明官軍手中的利器，火藥的作用居功至偉，但是黑火藥燃燒後產生大量煙霧和殘渣，既遮蔽了射手的視線，也暴露了射擊位置，給戰場上的隱蔽性帶來了極大挑戰。
這些殘渣不僅會在戰場上暴露官軍士卒的位置，還容易引起各種火器的故障。所以朱載坖要求儘可能的改進火藥配方，減少射擊之後所產生的殘渣。同時儘可能的提高火藥的威力，研究各種有專門用途的火藥。
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