朱載坖在西苑處理這些政務的時候，一向都會把皇太孫帶在身邊聽朱載坖怎麼處理這些政務，在重臣們走了之後，朱載坖問道：“今日有什麼收獲啊？”
皇太孫說道：“皇爺爺，這橋未能修好，本是工部的事情，為何皇爺爺要幫工部擔待？”
這確實是皇太孫所不能理解的，他認為天子怎麼能夠承認錯誤呢？即便有錯，都應該是臣子的錯，對於皇太孫的這個想法，朱載坖認為並不能夠算錯，在某種意義上來說，天子確實是不能認錯的，因為一旦天子認錯，有可能會挫傷天子的威嚴，這點是必須要考慮到的事情。
但是朱載坖認為首先是否認錯和是否改錯是兩個問題，朝廷的用兵行政，各種決策，不可能每次都正確，這點是毫無疑問的，即便是內閣、皇帝、部院再三討論的過的事情，在實際執行當中的也可能因為執行的問題出現各種各樣的問題，在這種情況下，朝廷就必須馬上予以糾正，這點是毫無疑問的。
朱載坖詳細的向皇太孫教導自己的經驗，天子的尊嚴不能侵犯，這點確實是一個必須要遵守的問題，但是天子的尊嚴並不是靠死不認錯的來撐起來的，對於天子的判斷和決策失誤，皇帝一樣應該承擔責任，不能諉過於下，就像這次的事情，工部和交通總署是按照朱載坖的旨意去執行的，決策是朱載坖本人作出的，工部隻不過是執行而已，在這個問題上，工部隻要沒有貪墨的行為，就不應該承擔責任。
既然是朱載坖所作出的決策，出現的問題，就應該由朱載坖承擔責任，否則的話，以後誰還為朱載坖實心辦事？這點是非常之重要的，駕馭臣子，不能一律以威淩之，朱載坖在之前確實是經常動用庭杖甚至是廠衛來收拾一些臣子，但是庭杖、廠衛主要是針對結黨亂政的臣子的，朱載坖最厭惡的是兩種人，第一種就是結黨亂政，煽惑君上的，這種人隻要被朱載坖發現，就肯定會予以嚴懲，另一種就是貪贓枉法的官員，一樣也被朱載坖所嚴懲。
朱載坖對皇太孫說道：“天子之威，固然是來自於乾綱獨斷，但是同樣也是要寄托於朝廷的。”
朱載坖仔細的為皇太孫講解這個問題，皇帝和朝廷之間，是一種很微妙的平衡，一方麵權力是有限的，皇權強大，臣權就要相對弱小，所以在權力這個問題上自然是存在衝突的，但同時，皇權和臣權也是合作的關係，對於臣子們來說，他們的權力合法性是來源於朝廷的，而朝廷的合法性或者說正統性又是來源於皇帝的，也就是所謂天命，官員們需要用皇帝的所謂天命來使得自己的權力合法化，而皇帝則是需要官僚隊伍治理國家。
所以皇帝和臣子們的關係是既鬥爭又合作的，臣權強大的時候，皇帝就得垂拱而治，如孝宗朝的時候就是如此，皇權強大的時候，自然是馭使臣子如牛馬，如太祖、成祖朝的時候，在之前的大明朝廷上，臣權和皇權往往是交替發展，此消彼長的，當然皇帝也會利用臣子們群體之間的矛盾，挑動群眾鬥群眾，世宗皇帝就是此中高手，更多的時候，皇帝的智商和精力都是極為有限的，依靠皇帝自己，確實是很難和這些科舉卷出來的人精們鬥爭的，所以皇帝往往都會放狗，也就是利用太監去製衡這些臣子們。
這在大明已經是很尋常的事情了，朱載坖對於君臣關係有不一樣的看法，首先和嘉靖一樣，朱載坖也善於利用孤臣，同時在臣子們的各個派係之間遊刃有餘，對於太監，朱載坖雖然比之嘉靖朝放鬆了，但是對於他們朱載坖整體的管束還是很嚴的，基本不會讓太監掌握過大的權力。
對於君臣關係，朱載坖認為還是要厘清出皇帝和臣子們的權力，同時抓大放小，朱載坖為什麼要將內閣予以製度化，並且加重內閣的權力，這看似是違背祖製的，因為太祖皇帝是明確禁止有類似宰相的機構或者是職務，而內閣恰恰是具備宰相的很多職能的。
但是朱載坖反而認為，這樣是對於祖訓的遵守，朱載坖仔細的和皇太孫講解了，對於皇帝來說，整個朝堂之上，主要就是存在著三種矛盾，第一就是君臣矛盾，君臣之間圍繞著權力的爭奪，自然是極為重要的，第二就是臣僚矛盾，由於是科舉選官，所以這個官員們根據出身、籍貫、學術、科名等們自然的分成若乾個團體，這些團體之間為了爭權奪利，自然是會互相傾軋。
而第三對矛盾就是閣部矛盾，從朝廷的體製上來說，內閣是皇帝的近侍幕僚機關，也是大明的決策機關，掌握著決策權力，而部院是具體的行政機關，負責執行，掌握著具體的行政權力，從品級上來說，內閣自然是領導著各部院的，但是在實際的政治運作中，內閣和部院不可能這麼和諧。
掌握決策權力的內閣自然是希望領導各部院，使得自己成為真正意義上的宰相機關的，但是各部院也不會這麼坐以待斃，事實上雖然從正統以來，內閣的權力就不斷擴大，但是當遇到強勢的部院大臣時，內閣也未必能夠完全將之壓製，部院和內閣關係，很多時候取決於內閣閣臣和部院大臣的個人能力。
當遇到張璁、夏言、嚴嵩這樣的強勢首輔的時候，那部院自然就俯首帖耳，好好當孫子，但是遇到楊博、王國光這樣比較強勢的部院大臣的時候，內閣也要慎重的聽取的部院的意見。
而朱載坖之所以要將內閣予以製度化，就是要明確內閣的權力範圍，杜絕出現權相的可能性，內閣作為皇帝和幕僚和決策機關，也是有其權力邊界的，一方麵朱載坖對內閣加以製度化，使得內閣有了明確的執掌，另一方麵也是對於內閣權力的限製。
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