麵對朱載坖的這個問題，太子也開始緊張的思考起來了，平衡內閣的各方勢力，這是一個皇帝的基本素質，嘉靖就是此中好手，對於朱載坖來說，玩這些也是基本操作，所以現在該朱翊釴來處理這個問題了。
現在內閣的情況就是申時行、王錫爵兩人聯手的話，壓製王家屏是絕對沒有任何問題的，晉黨的部院勢力強，而內閣勢力弱，這點是不爭是事實，沈一貫和羅萬化兩人雖然都是浙江人，在內閣有聯手的意思，但是羅萬化地位要更超然一些，同時羅萬化和申、王二人關係都還不錯，所以很大程度上申、王、羅、沈四人是能夠合作的。
而王家屏就相對處於弱勢地位，所以朱翊釴認為，在內閣的調整中，還是要以平衡為主，南北兼用才行，對於太子的這個看法，朱載坖也是很認同的，但是現在王錫爵的密疏在某些程度上來說是很有道理的，沈鯉督師南京時間確實是不短了，按照道理也確實是應該將沈鯉調回京師了，但是沈鯉和沈一貫的矛盾是眾所周知的。
所以將沈鯉調回來的，必定會加重現在內閣的矛盾，這點並不是朱載坖想要看到的事情，朱載坖更加希望的是內閣保持鬥而不破的狀態，即在內閣內部，首輔有權威能夠將自己的政策推行下去，而在內閣內部，群輔也能夠對首輔形成一定的製約，再加上部院對於內閣的製約，保證首輔的權力在一個合理的範圍之內，避免出現權臣的情況，但是也要保證內閣大體上的和睦，但是一旦沈鯉回朝，很容易激化內閣的矛盾。
同時督師南京大學士的職務任職是有回避的，南直、浙江等地出身的官員一向是不能夠被任命為督師南京大學士的，因為這樣會形成鄉黨，包庇自己的家鄉，所以一向都是由北方官員擔任的，而沈一貫是浙江人，這就堵死了二沈對調的路，同時二沈之爭背後牽連很大，這點朱翊釴是很清楚的，沈鯉這人有些過於清高，在官場上人緣不好，這是出了名的。
沈鯉為官清廉，斷絕私交。他老鄉大學士高拱當年是他那一榜的主考官，沈鯉卻從未曾因私事拜訪過高閣老。內閣首輔申時行也忌恨沈鯉不依附自己。初入翰林，同鄉宦官黃錦送禮給他拒而不收；訓教內書堂，侍講經筵，從來不與大宦官交往。而沈一貫就相對圓滑的多了，和申時行等人的關係很不錯，所以朱翊釴認為，要增補閣臣，以平衡現在的朝局，這點得到了朱載坖的認同。
不過對於應該怎麼調整內閣，太子感到還是有些棘手的，朱載坖笑著說道：“不謀萬世者，不足謀一時，不謀全局者，不足謀一世，這個道理，太子豈不知？”
朱載坖的想法是對於內閣的調整不僅僅要動內閣本身來看，更加重要的就是要從整個朝堂來看對於內閣的調整，能夠影響內閣的不僅僅是內閣閣臣本身，各個部院也是非常重要的，將內閣和整個部院要看作一體來管理，這點才是最重要的，同時對於內閣的調整，也不能夠一蹴而就，這點是非常之重要的，有些時候對於內閣、部院重臣的調整和調動，是皇帝和臣子互動的一個重要手段。
這點是朱翊釴現在還要仔細學習的，所以這幾日朱翊釴都在朱載坖身邊學習朱載坖怎麼調整這些重臣的，朱載坖首先調整的不是內閣輔臣，而是部院重臣，朱載坖命令將吏部尚書趙誌皋和司農卿楊俊民對調，原司農院卿楊俊民任吏部尚書，原吏部尚書趙誌皋調任司農院卿，這個任命是出乎很多的意料的，但是對於熟悉朱載坖的臣子來說，這並不稀奇。
朱載坖一向都是這麼乾的，先敲邊鼓，然後再動手，這種重臣的突然調任其實就是朱載坖給朝廷的明確信號了，就看你自己能否領會了，這次朱載坖將楊俊民和趙誌皋對調，對於晉黨來說自然是好事了，晉黨現在在內閣就剩下一個王家屏了，還是個無甚實權的輔臣，所以朱載坖將楊俊民調吏部尚書，就是加強王家屏在內閣的影響力，王家屏雖然資曆不深，但是楊俊民可不是等閒，作為晉黨的資深大佬，楊俊民的資曆是極為深厚的，畢竟是楊博之子，在晉黨內部和朝廷都有很深的威望，這點是其他人所比不了的。
楊俊民在吏部，影響最大的就是申時行、王錫爵等人了，因為之前的吏部尚書趙誌皋相對溫和，遇事不怎麼和內閣爭辯，一向以維持和睦為主，而楊俊民顯然不是什麼能任申時行拿捏的主，你們可以在內閣拿捏王家屏，但是楊俊民就要在吏部拿捏申時行了。
而朱載坖的這一調動，也立馬在朝廷上引起了波瀾，風向開始對申時行不利了，而在申時行府上，申時行、王錫爵兩人也正在分析朱載坖的想法，申時行也有些懊惱的說道：“元馭，此事老夫算是孟浪了啊！”
申時行現在確實是有些後悔的，原本王家屏在內閣雖然和申時行等人一直過不去，但是其實都在可控範圍之內，由申時行和王錫爵兩人，王家屏是翻不起什麼大浪的，但是之前王家屏在內閣多次譏諷申時行，申時行一怒之下準備把王家屏弄到南京去，免得他礙眼，就讓王錫爵上疏請求將沈鯉和王家屏對調，這下顯然引起了朱載坖的關注，對於內閣現在情況，朱載坖顯然是有些不滿意的，所以朱載坖才會將趙誌皋和楊俊民對調，這下王家屏反而在內閣支棱起來了，畢竟有楊俊民這個天官在背後撐腰，申時行還真不能把他怎麼樣。
申時行不是嚴徐高張，對於部院沒有那麼強的控製力，再加上楊俊民也不是個好拿捏的人，這下內閣和吏部之間再度有對抗的趨勢了。
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