這點兩位輔臣還是有自己的判斷的，朱載坖這次破例出席正旦日大朝會，無疑就是向朝堂傳遞非常之明確的信息，朱載坖還有能力掌控朝廷，警告這些官員們不要輕舉妄動，這點意味是十分之明確的。
兩位輔臣認為，朱載坖肯定會對於太子的這些政策予以肯定，然後以疾風驟雨辦掉一些官員，以顯示太子的權威，這點也是極有可能的，所以對於輔臣們來說，現在的重點問題就是怎麼應對的問題，朱載坖想要辦人，他們是攔不住的，而且這幫海商現在勢力做大，也確實是應該加以裁抑了，但是朝廷的穩定還是需要的，所以必須要控製其中的分寸。
而在賜假五日之後，朱載坖又以元宵節為名，再次給群臣賜休沐十日，這對於大明官員們來說就是很爽的事情了，大明的官員休沐確實是不多的，因為太祖他老人家覺得，你們這幫人吃了老朱家的糧，就得天天乾活，最開始除了正旦、冬至和聖壽之外，基本沒有休假，後來休沐製度逐漸規範。
官員每個月有5天假期，冬至放假三天。到了成祖時，又增加了元宵節休假政策，但元宵節休假政策並不是所有官員都可以享受，隻有朝廷官員可以享受，地方上的官員並沒有此特例。而且元宵節假期休不休沐，主要看皇帝的意思，皇帝特旨則可以休沐，有些時候皇帝為了惡心臣子們或者乾脆忘了，不下旨也沒有辦法，這次朱載坖特旨休沐，同時還加以賞賜，對於官員們來說是極為難得的。
因為大明的休沐製度有些過分，要根據官員身份地位的不同，給予不同的法定假日。如身份尊崇的庶吉士，“五日一休沐”；國子學的諸生，在每月的初一和十五休假。本朝也有過旬假製度，宣宗曾實行過“每歲首許百官旬休”的製度。但是後來又認為休沐過多，影響政務，故而予以取消了。
在法律地位上給予官員們假期隻有凡每歲正旦節，自初一日為始，文武百官放假五日，冬至節本日為始，放假三日。永樂七年，令元宵節自正月十一日為始，賜百官節假十日。但是在弘治三年，因為災異取消元宵的十日休假，之後這個假期就時有時無，全看皇帝心意了，這次朱載坖明確下旨，將這十日休假予以明確，從隆慶二十七年起，從正旦到元宵，連休十五日，這算是朝廷的一點福利吧。
但是重臣們卻並沒有休假的喜悅，一來是內閣輔臣和軍機大臣無論什麼時候都是要有人值班以應對突發狀況的，二來就是朱載坖到底在謀劃什麼，群臣們確實是不清楚的，這點對於重臣們來說確實是一個很頭疼的問題。
但是其實朱載坖最近的主要任務就是養病，在許長齡和萬邦忠的建議下，朱載坖在養心殿靜養，萬邦忠認為朱載坖至少應該先完全靜養半月之後，將元氣穩固下來，再慢慢進補，鞏固療效，然後緩慢調養才是，在這種情況之下，朱載坖就開始在養心殿中靜養。
許長齡和萬邦忠每日都要為朱載坖診脈之後調整藥方，同時朱載坖的飲食也被兩位翰林醫官管起來了，一些藥性相衝的食物不允許被使用，在兩位翰林醫官們的調養之下，朱載坖的身體勉強有所恢複，比之之前要好多了，但是萬邦忠認為朱載坖元氣虧損太大，現在的調養隻不過是稍微穩定下來罷了。
他建議朱載坖至少再靜養月餘再說，但是這個請求被朱載坖所拒絕了，朱載坖很清楚，皇帝長久的不露麵對於朝廷來說絕非好事，尤其是對於朱載坖來說，現在正是加強對於朝廷控製，幫助太子建立威信的時候，不過朱載坖也和兩位翰林醫官約法三章，首先就是仍舊要按時服藥，第二就是在天氣轉暖之後遷移西苑，第三就是控製批答奏疏和召見重臣的時間，不得過於勞累。
在元宵節之後，朱載坖還是開始正常開始召見大臣，處理政務，朱載坖首先關心的還是西域的戰事，李成梁之前奇襲伊犁河穀，到現在仍無音訊，朱載坖命令給西域總督吳兌下旨，要他想辦法和李成梁取得聯係，在有可能的情況之下，增派援兵和物資，同時就是準備大舉進入西域的官軍援兵，要在天氣轉暖之後迅速向交河等地前進，準備對西域南部展開進攻。
而隨後朱載坖就下達了一道上諭，嚴厲禁止以私函處理公務，以私函處理政務，是從嘉靖以來閣臣們經常使用的一各辦法，相比與朝廷的公開文書，這中私函私密性更好，所以很多輔臣們願意使用，徐階就經常使用，而李春芳、高拱等人也經常使用，而用的最多的就是張居正了。
由於張居正厲行改革，尤其是嚴厲執行考成法，地方官員執行時缺乏彈性，對政務完成期限的擔憂使官員不敢承擔責任，因此張居正以用私人信函彌補弊端。但是依靠私人關係處理政務，在這一過程中自然形成了張居正的私人交際圈，政見相合之群體與不合之群體分化。
張居正使用私函也確實是取得了一些成效，因為有一些事情是不便於在朝廷文書上落筆的，所以說張居正需要通過這些私函來實現政務的儘快處理，張居正以書牘強調如期完成公務的重要性。因為在考成法的實際執行過程中，官員為了應付考成法，在完成任務的過程中缺乏彈性，因循敷衍之風難以遏製。地方官員征收錢糧時，為完成指標不擇手段地。這些問題不好公之於眾，所以張居正使用私函予以處理，這點當時的朱載坖是同意了的，因為要儘快推動新政的執行。
但是從張居正之後，張四維、申時行等人也使用私函，這就不是朱載坖所願意見到的事情了，所以朱載坖覺得予以嚴厲禁止。
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