虧得崇禎即位，大赦天下，解除了黨禁，斥逐閹黨，為死難者恢復名譽，給還削籍諸臣官誥，劉宗周倖免於難，被起用為順天府尹，不久就因跟崇禎政見不合辭歸。

顯然地，崇禎在想：“這個劉宗周就是個書呆子，朕迫切需要朝臣們拿出一些行之有效的大治措施，他非要朕‘超然遠覽，以堯舜之學，行堯舜之道’。

朕說他迂闊，他竟說朕刑名之術，近於功利，人主應以仁義為本。哼，朕說不過他，自然也用不了他這樣的官，要不是實在人才匱乏，朕又怎麼會再次用他呢？不知這次他又胡說八道了些什麼？”

想著，低頭來看，但見上面寫著：《痛切時艱直陳轉亂為治之機以仰紓宵旰疏》。

崇禎耐住性子往下看，看罷，猛地把奏疏摔到了地上。

為啥呢？這個劉宗周，疏中居然對崇禎即位以來的所作所為和各項政策一一進行批判，言辭犀利，毫不容情。

臨末還說什麼“抑臣聞之，有天德者然後可以語王道，其要在於懼獨。故聖人之道，非事事而求之也。臣願皇上視朝之暇，時近儒臣，聽政之餘，益被經史，日講求二帝三王之學，求其獨體而慎之，則中和位育，庶幾不遠於此而得之。”

溫體仁趕巧進來，忙撿起來看，亦是哭笑不得。

崇禎怒道：“傳諭內閣，從重懲處。”說罷，忍不住又想：“他不過一腐儒，所言於人於事無害，又是名人，素有清名，朕何不放他一馬，也樂得一個能容直言的名聲。”

想到這裡，又道：“還是算了吧，不過是些迂闊的陳詞濫調，朕不跟他計較。”

溫體仁忙跟著附和，私下裡卻忙命人上疏彈劾劉宗周。

劉宗周卻是不知，正衝向剛從外面回來的兒子劉伯道：“道周說的沒錯哪，鄭鄤正直而遭顯戮，文士而蒙惡聲，古今無甚於此者。何故也？皆父疏中所言也。”

劉伯道：“大家都知道，鄭鄤冤枉，父親大人也沒有必要上那奏疏吧，您或許不知道，外面都傳遍了，說若不是皇上能容直言，父親大人因此丟了命也未可知。”

劉宗周道：“鄭鄤案只是為父上疏的直接原因，更重要的還是，及既拜命，則不便再容易抽身，只得以老病之身許之君父，意欲得當以報君恩，以了生平耿耿之懷，是以有前日之疏。

為父倒並沒有想到自己的安危，想那皇上肯下《罪己詔》，應該不是不容直言的人，卻做出了此等糊塗之舉。

唉，其實，為父也為難哪，犯顏直言吧，人家認為迂闊，不高興，不說吧，又對不起自己作為孔孟之徒的良心。”

劉伯想想也無法，道：“這下好了，也有人上疏了，說父親大人才謂不足而道學有餘，主治未獲經綸之益，甄士殊多砥礪之功，又該咋處？”

劉宗周道：“既如此，告病求歸就是。”

說完，竟親自去寫了奏疏上奏了，又道：“我始終認為，人心為禍之烈，皇帝躬親庶務之非，必須自去其聰明，慎獨用賢，昭世教以正人心，崇儒重道，始可救衰亡於萬一。”

崇禎巴不得他快走，當即批了。

劉宗周也不多說，當即收拾了啟程。行至德州，仍不放心，再上《微臣身切時艱敢因去國之轍恭申慰悃兼附芻蕘之獻疏》，極言賢奸顛倒，任用匪人之禍。

崇禎大怒，降旨：“劉宗周明系比私敵政，顛倒是非，姑著革職為民！”