九州府兵聲勢浩大而來，卻兵不血刃而去，杜行敏抓獲李佑，繞城而示眾，關押於王府東廂，齊州之亂由是平定，李勣領軍入城，各自撫民，一邊上表奏聞，一邊押解了李佑，送至長安，同黨四十餘人一併誅殺，吊於城頭示眾，其餘人等既往不咎，齊州民眾由是降服安定。

李勣帶著徐真和杜行敏等一干有功之臣，入朝覲見，聖人不悲不喜，平了叛亂，卻又少了一個兒子，加上太子之事，憂煩未消，也無甚寬慰可言，但未免寒了人心，還是授杜行敏為巴州刺史，封南陽郡公，其餘諸人皆有賞賜。

這李佑性格乖張，頗為聖人不喜，朝堂之上仍舊自恃血統，篤定了聖人不敢殺之，李世民正為李承乾生死所擾，受不得李佑的氣，遂以謀反之罪，貶為庶人，賜死於太極宮內省，蓋因無子，國封盡除。

聖人到底寵愛太子，日夜牽掛卻不得方法，如何也處置不下，遂將一干從犯作了處理，杜荷等人盡皆斬首，抄沒家產，親眷多有流放。

至於侯君集，聖人念顧多年舊功，親至牢獄之中訣別，但言從龍多年，不忍刀筆吏辱之，侯君集回憶舊時光，悔恨難當，趁勢替家人求饒，聖人一併赦免。

未過幾日，侯君集授首，妻子得以赦免，流放嶺南，而張亮、紇幹承基等人檢舉有功，皆由封賞。

段瓚由於未參與過深，並未受到牽連，其父病危之時，聖人嘗親**問，打算封段瓚，其父卻請求將官職轉封叔父段志感，大抵段公有先見之明，才不使兒子深陷權爭之泥沼。

及段公病逝，追贈輔國大將軍，揚州都督，諡號莊肅，並陪葬於昭陵，段瓚此番也得了封賞，遠離了長安。

連那賀蘭楚石，都因為在受審期間，主動揭發了侯君集的罪行，而獲得了赦免，謀反一案盡數清算，唯獨太子之事，終無定論。

聖人將其幽禁別室，召見司徒長孫無忌、司空房玄齡、特進蕭瑀、兵部尚書李勣、中書侍郎岑文字、諫議大夫褚遂良等以參，然無人敢提議。

事皆明驗，線索清晰，按律當誅，聖人自是心知肚明，然太子之所作所為固然使得聖人失望，可畢竟是聖人疼愛的長子，為了將其培養成合格的儲君，聖人可謂費盡了心血和精力。

聖人終究是丟不下愛子，奈何聖人執法自律，總不能公然抗法，所謂天子犯法與庶民同罪是也。

諸多臣子深諳這份父子情誼，然又各懷鬼胎，如長孫無忌之流，有大野心，早想著扶植晉王李治，岑文字等又看好魏王李泰，都恨不得徹底將太子從聖人心頭抹去，此番一個個噤若寒蟬，不敢諫言。

徐真依稀記得史料所載，有個什麼通事舍人的小官站了出來，於朝堂之上為太子求情，給了聖人一個臺階，終於保住了太子的小命。

然等待了許久，也不見那史料之中的小官挺身而出，遲疑了片刻，終於出列而奏曰：“臣位卑言輕，然心中有言，不吐則不快…”

李世民見諸多大臣無人出頭，正滿懷失望，見得徐真出列，頓時心頭暗喜，卻又強捺下來，假裝隨意道：“徐卿可直言無妨。”

徐真這才直起身子來，奏聞道：“陛下上不失作慈父，下得盡天年，即為善矣，夫太子之誤，何嘗不是教育制度所壓迫，臣雖為武將，但自認朝廷當重視教育，多顧學宮，以免再次重演太子這番事情…”

徐真要給聖人一個臺階下，這也不是什麼壞事，壞就壞在他最後那段話，雖替太子開脫，卻將罪責推到了教育上來，這般一來，諸多文臣又豈能容忍，紛紛將徐真視為無知莽夫，一言蔽之，樹敵無數！

然聖人聞言卻是心頭安定了下來，頗為認同徐真的言論，李綱和于志寧等慌忙出列認罪，聖人當然不會遷罪，又讓一干文臣拿出政策來，扶持國子監等學問之地，免得疏忽了人心教育。

諸人知曉聖人與徐真做戲，惶恐了一陣就安靜了下來，是故將李承乾廢為庶人，流放黔州，終於是保住了性命。

長孫無忌見有時機，又趁勢舉奏，言稱晉王李治多有經緯之才，可主導文事，期盼聖上栽培。

這廂才了結李承乾的事情，長孫無忌就急於支撐晉王李治，諸人也嗅聞得出來，太子廢黜之後，重新立儲就需提上議程，這長孫無忌倒是不顧聖人心意，如此交關的時機，就開始搶佔先機。

時晉王年不過二十，心性尚幼，長孫無忌多弄權術，又是晉王的舅父，其中陰暗，難免使人猜度。

岑文字和褚遂良等一干正直臣子，則認為魏王多才厚學，又寵冠諸多皇子，乃聖人最愛，宜立魏王。

遂反駁長孫無忌，稱魏王自幼善學而多智，聖上嘗以李泰好文學，禮接士大夫，特命於其府別置文學館，自行引召學士，魏王泰更是著作等身，早於貞觀十二年就大開館舍，廣延才俊，耗費三年時間，編纂鉅作《括地誌》。

此志乃地理人文風俗大作，凡五百餘卷，記述貞觀年間地理風物、疆域區分和州縣設定，博採經傳地誌，旁求故事舊聞，詳載各地山川物產，古蹟風俗，人物掌故等等，歷時三年而就，獻與聖人，龍顏大悅。