這些附庸主要有巴魯剌思家族、朵豁剌惕家族杜格拉特部）、乃蠻家族、剩亦兒家族、速勒多斯家族等。最大的則是巴魯刺思和朵豁刺惕兩家族。
後來察合台汗國陷入長期內鬥，貴族之間相互廝殺，慘烈程度比西晉的八王之亂猶有過之。
結果就是附庸家族做大，開始私行廢立，稍有實力的軍事貴族都將與自己關係親密的察合台後裔擁上汗位，一時間到處都是"察合台汗"。
1346年,巴魯剌思家族的哈劄罕殺死了合讚算端汗，其根據地是在汗國西部河中地區，就是前文提到的部分“外西北”。
朵豁剌惕家族的掌門人播魯隻，控製著汗國東部"向陽地"。
是指包括蔥嶺以東的喀什噶爾、英吉沙爾、葉爾羌、和田、阿克蘇、烏什六城和蔥嶺以西的費爾乾地區。
播魯隻有樣學樣，立即擁立了一位名叫禿黑魯帖木兒的察合台宗王為汗。
察合台汗國就此分裂，禿黑魯帖木兒統治的地區就是東察合台汗國。
禿黑魯帖木兒成為可汗時才16歲，屬於被權臣扶植的傀儡。但這位是像漢宣帝劉病己那樣的厲害角色，他也想掌權啊。
琢磨來琢磨去，還真被他找到一條擺脫權臣，拿回權力的辦法。
朵豁剌惕家族所掌控的向陽地，絕大多數居民是穆斯林，禿黑魯帖木兒心想：“我鬥不過貴族，但我可以發動群眾啊！”
可是要發動群眾，就得先成為他們中的一份子。於是禿黑魯帖木兒把心一橫，咬牙剪斷了長發，皈依了伊斯蘭教。
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這個過程也沒那麼簡單，是經曆了十幾年的醞釀才完成的。
當時的蒙古人普遍信仰佛教，禿黑魯帖木兒一不小心創了個紀錄，他是所有蒙古汗王裡，第一個皈依伊斯蘭教的。
東察合台汗國的貴族一看，也不得不選邊站隊，最後就帶動十六萬蒙古人集體皈依。
請注意，這十六萬蒙古人是東察合台汗國的“大多數”，但不是全部。
因為當時禿黑魯帖木兒控製的地盤還沒那麼大，他在統治區域內強迫其他宗教的教徒改變信仰，彆人當然不會心甘情願。
比如在阿力麻裡今伊犁霍城縣一帶），基督教有很大勢力，而庫車阿克蘇東部）等地更是佛教的天下。
阿力麻裡曾經是察合台汗國的都城，長春真人丘處機就在阿力麻裡吃過蘋果，耶律楚材和馬可波羅等人也都到過那裡，一度繁盛無比，被稱為“中亞樂園”。
這些地方的異教徒組織暴動，但被汗國正規軍鎮壓，阿力麻裡的基督徒或死或逃，從此不複存在。
伊斯蘭教長組織了"庫車伊斯蘭教社團"，在軍隊的支持下拆毀佛教寺院，搗毀佛像，焚燒佛教經典文獻，屠殺佛教徒。
後來禿黑魯帖木兒的小兒子黑的兒火者繼承了汗位，他以聖戰的名義向哈剌火州、吐魯番發動戰爭。
哈剌火州軍民進行了頑強抵抗，但因為黑的兒火者汗事先派了很多間諜潛入城中，在城中進行策應,哈剌火州最終還是陷落了。
就因為哈剌火州的抵抗，事後黑的兒火者進行了報複，他將哈喇火州被定為重稅區，居民被課以重稅，並被強製放棄原來的信仰。
此事距今也就十幾年時間，長期遭受壓迫的哈剌火州人心未附，可說是麵和心不和。因為汗國東部人口分散，仍以遊牧為主，而且與主體有宗教方麵的分歧，故而塞軍一開始就沒把這些散兵遊勇當作主要打擊目標。
既然人家主動投誠，藍太平也就順水推舟，欣然接受了。
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