綜合考慮，李純決定按照立長立賢的原則，在夏原遷都後不久，也就是元和十一年三月，正式冊封長子李寧為太子。為了鍛煉李寧，李純有意讓他參加處理一些政務，還派人帶他到一些地方遊曆，增長見識。
李寧的表現還不錯，在大臣麵前相對謙虛，從來不擺架子，做事認真，有點像儲君的樣子。可能是因為有些隱疾的原因，李寧的身體不太好，李純對此有些擔心。
元和十二年十二月，洛陽到夏原的鐵路在熱火朝天的建設，李純就想到夏原城北的施工現場視察一下，想著帶上太子李寧，一起去查看一下鐵路進展情況。宮人突然報告說，太子李寧病重，李純趕緊起駕向東宮趕去。
到了東宮，隻見太子處於昏迷狀態，有兩三個太醫在守著，太子的母親紀妃也趕來了，坐在那裡哭哭啼啼。
李純趕忙詢問情況，太醫報告說，太子的心臟有些問題，可能有梗塞的情況，目前脈搏微弱，生命垂危，形勢很不好。李純感覺像天塌了一樣，急忙下令太醫們想儘一切辦法，搶救太子的性命。
幾個太醫嘗試了各種辦法，又是喂藥，又是按壓，忙到晚上，還是回天乏力，太子李寧最終失去了氣息，宣告死亡。
紀妃哭的死去活來，李純也是悲傷不已，自己最看好的長子，居然就這樣突然走了。自己開創的大唐盛世，還需要人去繼承發揚，一個孩子剛成年不久，正是乾事業的黃金年齡，沒有任何預兆就撒手人寰。
李純宣布罷朝三日，命令禮事部給太子辦了隆重的葬禮，葬完李寧後，李純心情頹廢，度過了一個壓抑的春節。
到了元和十三年春，李純仍然興致不高，本想把政務委托給李吉甫，自己清閒一段時間。沒想到崔群來報，李吉甫病了，病的還挺厲害，無法上朝，請求皇帝讓彆人代理左丞一職。
李純有點蒙圈了，怎麼黴運連連，身邊人接連遭難，趕忙到李吉甫的府上探視。
李純剛即位的時候，李吉甫正好從地方州刺史的崗位入朝為官，在任上非常勤勉能乾，做事細致認真，各種數據、資料熟記於心，還專門編著了《元和郡縣圖誌》，此書成為李純為了解唐朝情況的重要典籍，也為朝廷施政提供了依據。
在李純心中，李吉甫超越所有的大臣排在第一位，自他擔任左丞以來，協助李純辦了不少大事，他對很多事情的看法甚至和李純心意相通，君臣之間配合的非常好。
很多事，李純隻是交代了一下，李吉甫就會帶人認真的籌劃和執行，結果總能讓人滿意。
身為宰相，李吉甫沒有多少架子，和同僚關係處理的不錯，好幾次大的機構和人事變動，李吉甫都去做了不少工作，保證了改革的順利進行。
可以說，李吉甫是李純的重要助手，發揮了不可替代的作用，李純甚至對他有了一些依賴感，很多事直接交給他處理。
李純到了李吉甫的府上，看到李吉甫躺在床上，氣色差了很多，一臉病容。看到李純來了，李吉甫還要勉強起來行禮，李純趕忙將他按下，示意他躺好。
李純道：“吉甫為了國事操勞辛苦了，身體要緊，先靜心養病，安心歇息一段，等病好了再回朝廷。”
李吉甫說：“臣的老毛病，臣很清楚，這次病的厲害，恐怕難以繼續為朝廷效力了，還請皇上早點物色合適的人選接替臣。”
李純道：“眾臣之中，唯有你的能力最強，最合朕意，沒有誰能代替你，朕還需要你幫助朝廷開創更好的盛世。”
李吉甫說：“皇上謬讚了，能跟著皇上乾事業，是臣的榮幸，看著大唐在皇上的帶領下，一天天強大，臣也能出一些力，臣感到特彆榮幸。”
李純道：“這些年你也付出很多，不少具體事都是都是你帶著其他人在做，你在後麵默默做了很多貢獻，朕都清楚。其實朕還有很多設想，想跟你商議，想和你一起做更多事，把大唐建成亙古未有的強大王朝。”
李吉甫說：“陛下的奇思妙想太多，格局很大，氣魄也大，采取很多有效措施，用了十二年，就讓大唐重現盛世，文治武功甚至超過太宗皇帝。不知陛下所說的亙古未有的強大王朝，是什麼樣子，臣是恐怕沒有機會看到了，但是很想聽聽。”
李純道：“這個世界很大，但是有邊界的，朕準備把大唐以外所有的疆域都拿下來，建立一個由華人統治的超級王朝，華人成為領導民族，都都能過上有地位、有榮耀的好日子，但是實施起來要很久，朕都怕自己中間也生病倒下，無法實現。”
李吉甫說：“自有華夏以來，漢人過上好日子的階段屈指可數，大部分時間不是動亂就是衰落，我們大唐也隻有貞觀和開元年間，漢人揚眉吐氣過了一些好日子，天寶年間安史之亂以後，我們大唐就衰落了，臣也盼著漢人能過上陛下所描述的好日子。”
李純道：“華夏民族，是世界上人數最多，也是最聰明、最勤奮的民族，隻要能夠聚集力量發展，一致對外，強大起來本沒那麼難。最大的教訓是內鬥太多，多次讓異族鑽了空子，還有一些帝王荒淫無度，大臣貪汙腐敗，把好好的國家給敗壞了。”
李吉甫說：“陛下說的很對，一個國家，帝王和大臣的作用很重要，臣觀陛下，睿智敏達、操勞國事，勤儉律己，給我們臣子做了很好的表率，連臣有時都要稍微享受一下，陛下對自己要求太高了。”
李純道：“老子說，勤以修身，儉以養德，為了實現那個宏大的目標，朕總感覺有很多事要做，有太多需要改革推進的事項，需要不斷的思考，不停的出新措施。生活方麵，稍微享受一些，也不會有任何問題，但是朕怕的是抵不住人性的弱點，會像當年玄宗皇帝那樣，被享受腐蝕了意誌，前明後暗，斷送了大唐發展的路徑。高處不勝寒，朕的一舉一動都會影響天下人的看法，如果朕自己都在享受，還有什麼底氣要求子民們艱苦奮鬥，反腐更是一句空談。”
李吉甫說：“一直以來我都沒有深刻理解陛下的苦心，今天算是真的感受到了，反腐搞了那麼多年都沒法解決，陛下有信心嗎？”
李純道：“說句實在話，朕有大的決心，但是也沒有十足的把握，畢竟腐敗深藏於人性的弱點之中，要根除很難。所以朕也隻是一點一點的在作努力，估計要達到理想效果起碼還要二十年。”