軍機處的軍機大臣們自然是很清楚有軌馬車在軍事上的作用的，不僅僅對於朝廷調動兵馬，轉運各種後勤物資有極大的好處，同時對於朝廷加強對於地方的控製也有極大的好處，所以軍機大臣們是要求立即大修軌道，加強官軍的機動能力，但是被朱載坖所製止了。
朱載坖很清楚，有軌馬車並不是最好的解決問題的辦法，雖然現在的有軌馬車比之之前的馬車有很大的進步了，但是仍然是有缺陷的，這種在軌道行駛的馬車不僅乘坐時較為舒適，用這種有軌馬車運送貨物，馬車的載重量還是普通馬車的兩倍。但它也有明顯的缺點，即整個動力係統還是靠畜力，其運輸效率較之於傳統馬車並沒有質的提高，且鋪設鐵軌的費用又高。最重要的就是以騾馬的力量大小，使得這些有軌馬車隻能在平原使用，一旦地形起伏過大，就不好用了，這點朱載坖是很清楚的。
不過這種有軌馬車作為技術儲備是很好的，大明要以這種有軌馬車推動軌道的標準化，還有車廂等一係列技術的標準化，同時在這些戰事結束之後，日常政務的處理則是照舊交給了太子，朱載坖的主要任務就是教導皇太孫和與朱載堉等人商討有關科學之事。
朱載堉對於這個從西洋來的伽利略極為欣賞，他確實非常之博學，對於天文、物理、算學都極為精通，而伽利略在大明也覺得十分之自在，一來是在大明沒人歧視他的日心說，相反在大明，很多人認為日心說是正常的，二來就是朱載堉、朱載坖對於他都十分之重視，對他十分之禮遇，物質生活也極好，朱載坖對於他的研究也極為支持，從朱載坖的內承運庫裡拔根毛都夠伽利略玩很久了。
朱載坖甚至讓他向皇太孫教授算學、物理、天文等常識，這在大明是前所未有的事情，很多翰林們是極為不滿的，自己兩榜進士，翰苑菁華，朝廷堂堂儲相，陛下不讓他們為皇太孫講授，一個西夷，就因為會點天文、物理，就可以為皇太孫進講，還有天理嗎？還有法律嗎？還有王法嗎？
但是朱載坖依然故我，除了讓伽利略等人進講之外，徐渭、楊俊民等重臣也都奉詔輪番進講，內閣輔臣們也是經常為皇太孫進講，同時朱載坖還從武當山、天師府延請名師，與京軍、錦衣親軍中的好手一道教導皇太孫習練武藝，參與京軍訓練，熟悉軍伍之事，朱載坖認為，皇帝一定要控製住軍隊和錢糧，要是這兩點抓不住的，這個皇帝注定是個沒有作為的皇帝。
而對於大明來說，朱載坖很清楚，要想保證大明的國力和日後的發展，科技問題是一個極為重要的問題，所以朱載坖一向對於此事是極為重視的，不僅僅要依靠大明自己的培養，也要大力引進外來的人才，他山之石可以攻玉嘛，所以朱載坖在和朱載堉等人商量了之後，對於格物院等予以了改組。
朱載坖將欽天監也並入格物院之中，負責天文、曆法等事項，因為格物院中有大量精通算學的人才，對於大明來說是很重要的，除此之外，就是要細分科目，便於各項科學的發展，如物理，那就是力熱聲光電五門，化學現在主要就是元素等的發現事項，對於朝廷來說，不僅僅是要有朝廷的這些科研機構予以研究，同時也要鼓勵民間的研究。
這點朱載坖是很清楚的，朱載坖命令格物院編寫有關教材，在朝廷各級學校中通行，同時也是培養民間的科研力量，鼓勵發現，對於各種進步，都要予以獎勵，如化學方麵，對於元素的發現就要予以鼓勵，元素是構成物質的基本成分，不能通過化學方法分解為更簡單的物質。民間能夠發現一種元素的，都予以賞賜並且得官，進入格物院任職。
還要招納西洋的學者，對於伽利略，朱載坖是十分之重視的，在和朱載堉商量之後，朱載坖下旨給他賜姓朱，賜名從道，任命他為格物院丞，正五品，並且特旨借緋，也就是允許他穿四品服色，可以穿緋色冠服，對於朱載坖的禮遇，朱從道自然是極為感激的，當即表示會寫信招攬更多的人才到大明來。
對於朱載坖來說，現在首先就是要解決各種量具和計量單位的問題，不管是氣壓的測定還是溫度的測定，格物院都已經掌握了理論，但是要將這些理論轉化為標準的計量器具，是一個問題，不僅僅需要格物院的原理，同時需要文思院的能工巧匠，這點朱載坖是十分清楚的。
而且隨著教育的普及，大明新一代的工匠也有了一定的文化水平，不再僅僅是依靠經驗了，朱載坖命令將文思院的部分能工巧匠選送格物院，與格物院一道研製大明的各種計量器具，其中最重要的就是長度、溫度、氣壓、重量等計量器具的研製。
朝廷要實現所製造的軍器、車船等器物的零件通用，精密的計量器具是必不可少的，之前朱載坖也已經頒布了一次各種量具，但是不夠精密，現在朱載坖要研製更加精密的量具。
以最常見的卡尺為例，朱載坖希望儘可能的精密，測量精度要達到百分之一寸以上才行，其原理格物院已經有了，卡尺由尺身及能在尺身上滑動的遊標組成。若從背麵看，遊標是一個整體。遊標與尺身之間有一彈簧片，利用彈簧片的彈力使遊標與尺身靠緊。遊標上部有一緊固螺釘，可將遊標固定在尺身上的任意位置。尺身和遊標都有量爪，利用內測量爪可以測量槽的寬度和管的內徑，利用外測量爪可以測量零件的厚度和管的外徑。深度尺與遊標尺連在一起，可以測槽和筒的深度。尺身和遊標尺上麵都有刻度。量爪並攏時尺身和遊標的零刻度線對齊。
雖然看似原理不複雜，但是實際要達到高精度並不簡單。
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