之前馬棟就派遣官軍以原唐安西都護府所殘餘的夏爾溝堡作為防禦重點，守住阿拉溝口，但是前唐的堡壘雖然沒有倒塌，但是一時之間也難以修複，同時這個堡壘僅僅是當年的大唐邊軍的一個小型堡壘，並不能供大軍使用，所以馬棟也隻出了一個守備千戶所駐守此地，同時加強了火炮。
為了防範葉爾羌的進攻，官軍在此地修建了烽燧，和不遠處的阿拉溝口官軍相聯係，同時在馬棟到任之後，利用葉爾羌軍隊還沒有來襲之前的這一段時間，全麵恢複了原來大唐在交河的烽燧體係，漢唐時交河是中原王朝經略西域的重鎮，交河地區曾建有百餘座烽燧，構成“邊烽互望”的防禦網絡。木爾吐克薩依戍堡作為高昌至北庭的首個軍事堡壘，兼具盤查與駐兵功能。
唐在連接交河四麵的荒澤沙磧、一望無際的戈壁沙漠中建有上百座烽燧，形成了“寒驛遠如點，邊烽互相望”的形勢，由於時間緊急，不可能全部予以恢複，但是馬棟還是在交河的西部和西南方向恢複了六十八座烽燧和戍堡，作為大明官軍屯兵防備葉爾羌之用。
而葉爾羌人所遇到的第一個堡壘就是夏爾溝堡，大明官軍以唐代舊戍堡為核心，臨時用土木修建了一道胸牆，將從西而來的道路予以截斷，同時為官軍的火器提供掩體，見葉爾羌大軍抵達，守衛夏爾溝堡的官軍當即點燃了烽燧示警，很快官軍通過烽燧向交河示警，身處交河的馬棟也看到了衝天而起的烽煙。
親衛趕緊進來報告：“公爺，西麵有烽煙！”
馬棟當即命令向西麵派出尖哨，查探葉爾羌的兵力虛實，而葉爾羌汗國的騎兵也紛紛下馬準備步戰，夏爾溝極為狹窄，騎兵根本施展不開，當年安西都護府所選擇的地址確實是極為刁鑽的，官軍雖然隻有一個守禦千戶所，而且是衛所官軍，但是守衛此地仍舊還是有把握的。
葉爾羌人原本想勸降官軍，但是還沒有上前就被官軍的火銃給打了回來，這使得葉爾羌主帥極為惱火，官家不到一千，仗著天險就敢這麼輕視他們，當即就決定衝鋒，和衛拉特或者是北虜不同，葉爾羌汗國雖然也是蒙古人，但是由於在西域南路經營很久，雖然仍舊保留著蒙古的很多風俗，但是在作戰上已經和傳統的遊牧蒙古人有很大的區彆的。
他們的甲胄裝備量很大，而且基本使用的是西域風格和的甲胄，長甲至膝，陣型森嚴，這點是北虜所不能比的，所以之前在官軍所收集的情報中就明確說道：“凡回夷將戰之時，有金鼓旗幟，行列部伍，其陣森嚴整齊，穿長甲至膝，左手懸鐵牌一麵。下馬步戰，能用弓刀。自朝至夕，直戰一日不退，非如北虜三兩衝即退也。”
這點是他們和其他蒙古人所不同的地方，這些葉爾羌人下馬準備之後，隨即就列隊對官軍的營壘發起了攻擊，防禦此地的守禦千戶原是李成梁麾下把總，因傷從鎮協官軍中轉任衛所，戰場經驗還是十分之豐富的，所以他嚴令麾下的士卒要將葉爾羌人放到三十步之內在打。
因為這些葉爾羌人本身都裝備有甲胄，其前鋒還有盾牌，距離如果太遠，官軍火器的威力就會大打折扣，甚至不會對這些葉爾羌人構成什麼威脅，而且自己所統帥的不是朝廷精銳的鎮協官軍，而是衛所官軍，他們雖然也操練，但是訓練水平是明顯不如鎮協官軍的，他們的射擊精度是顯然不能和鎮協官軍相提並論的，放近距離，才能夠提高命中率，同時讓這些士卒們看著敵人在麵前被打倒，也能夠提振士氣。
守禦千戶嘴裡叼著根草根，在官軍的營壘前來回巡視著，同時大聲說道：“你們這群小崽子，今日算是走了大運了，老子跟著李大帥，從遼東打到西域，仗仗都是硬仗，圖們汗那是蒙古大汗，李大帥帶著老子們一仗就把他打垮了，生擒送到京師去了，老子也是在德勝門見過陛下的。老子這個千戶，也是砍了十七八個狗韃子的腦袋才得的，你們這次是走了大運了，狗韃子排著隊來，你們隻要勾勾手指，就是軍功，不管是小旗、總旗還是百戶，就看你們的本事了！給爺瞄準了放近打，想當官，就看你打不打的準了！”
在千戶的激勵之下，官軍士卒的緊張氣氛開始緩解了下來，這些士卒們都是隆慶初年生人，從他們生下來，聽得就是大明官軍戰無不勝攻無不克消息，所以這些士卒們的士氣還是相對不錯的，對於這些士卒們來說，他們確實是想通過軍功改變命運，這點在隆慶年間還是有保證的，至少對於衛所士卒們，朱載坖兌現的分給土地的承諾，衛所士卒們現在都手握地券，要是能夠博得個功名，對於這些士卒們來說就很好的。
千戶雖然說的輕鬆，但是內心並沒有這麼這麼輕鬆，他還是很清楚的，葉爾羌來勢洶洶，要是真的不計傷亡的話，僅憑自己這一千不到的衛所官軍，肯定是難以抵擋的，但是他同樣很清楚，作為朝廷五品，也算是中級軍官了，他還是知道很多內情的，交河是大明在西域重要的倉儲所在，城內儲藏的糧秣超過三百萬石，軍器、甲胄等能夠武裝近十萬大軍，而他們所在的夏爾溝堡就是交河城的第一道防線，他們必須死死的頂在這裡，為交河和身後的阿拉溝堡爭取時間。
同時他已經差人向阿拉溝堡報告這裡的情況了，他也是戎馬半生的人，對於現在的情況，他還是非常之清楚的，葉爾羌勢大，即便是馬棟手中，恐怕也沒有多餘的兵力來支援自己，除了死守夏爾溝堡，為交河爭取時間之外，他沒有彆的選擇，這點他還是很清楚的。
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