吳國金在孔興燮等人的陪同下，穿過第一進狹長的庭院，迎面便是孔府中路的第二道大門，俗稱二門。
孔府的二門建於大明初年，門楣高懸明代詩人、吏部尚書、文淵閣大學士李東陽手書"聖人之門"豎匾，下有閥閱承託，門柱有石鼓夾抱。正門左右各有腋門一座，耳房一間。平時來人只走腋門，正門不開，以示莊嚴。
可是此時，孔興燮卻快走了幾步，招呼左右將正門開啟，陪同吳國金從正面進入後面。吳國金見狀卻依舊面無表情，根本不予理會。
入聖人之門後，迎面是一座小巧玲瓏、別具一格的屏門，此門建於弘治十六年，門為木構，四周不與垣牆連屬，獨立院中，類似遮堂門。
屏門頂覆灰瓦，門楣因懸明世宗親頒"恩賜重光"匾額，故稱"重光門"。門的四根圓柱下有石鼓夾抱，上面承託著彩繪的屋頂，前後各綴有四個倒垂的木雕貼金花蕾，故又稱"垂花門"。
這重光門在平時也是不開的，只有每逢孔府大典、皇帝臨幸、宣讀詔旨和舉行重大祭孔禮儀時，才鳴禮炮開啟。
此時孔興燮也許是慌亂了手腳，又要招呼人去開啟重光門，卻被吳國金攔下，於是眾人便繞過重光門，繼續向裡面走去。
重光門因獨立院中，把前院和後院隔絕開來，所以又叫"塞門"。據說這樣的塞門一般官司宦人家是無資格建立的，只有封爵的"邦君"才能享受此榮，故《論語·八佾》中有"邦君樹塞門"的記載。重光門兩面三刀側的東西廳房，是孔府仿照封建王朝的"六部"而設立的六廳。
為了保持與外界的聯絡，在內宅門專設兩種傳事的差役，一種叫差弁，一種叫內傳事都有十幾人，輪番在門旁耳房內值班，隨時向外和向內傳話。門的西側還有一個露出牆外特製的水槽石流，府內規定挑水夫不得進入內宅，只把水倒入槽內隔牆流入內宅。
眾人過了重光門，院中有一片臺基，臺上原有日晷等物，其後便是寬敞的正廳，這裡便是孔府的大堂。
這是歷代衍聖公宣讀聖旨、接見官員、申飭家法族規、審理重大案件，以及節日、壽辰舉行儀式的地文。
府中正堂有廳堂五間，進深三間，灰瓦懸山頂。簷下用一斗二升交麻葉斗拱，麻葉頭出鋒，座鬥鬥欹，具有明代風格。大堂中央有一繪流雲、八寶暖閣，正中的太師椅上，披鋪一張斑瓓虎皮，椅前狹長高大的紅漆公案上，擺著文房四寶、印盒、籤筒。
大堂正中懸掛著一個"統攝宗姓"匾，要歷代衍聖公"統攝宗姓，督率訓勵，申飭教規，使各凜守禮度，無玷聖門"，規定了衍聖公在孔氏家族中的種種特權。從唐代起，歷代朝廷就規定曲阜縣令由衍聖公兼任，到了明代以後，規定由衍聖公保舉孔氏族人兼任。
在大堂的堂內兩旁及後部陳列著正一品爵位的儀仗。如金瓜、朝天鐙、曲槍、雀槍、鉤連槍、更鼓、雲牌、龍旗、鳳旗、虎旗、傘、扇等還有一些象徵其封爵和特權的紅底金字官銜牌，如"襲封衍聖公"、"光祿寺大夫"、"紫禁城騎馬"、"奉旨稽查山東全省學務"等，每當衍聖出行時，都有專人執掌，以示威嚴。
大堂之後有一通廊與二堂相連，兩堂呈"工"字形。通廊裡有一條大長紅漆凳，稱"閣老凳"。據傳明代權臣嚴嵩被劾將要治罪時，曾到孔府來託其孫女婿衍聖公向皇帝說情，孔府主人未允。此凳系當年嚴閣老坐候之物。
在大堂的後面也叫後廳，是衍聖公會見四品以上官僚及受皇帝委託第年替朝廷考試禮學、樂學童生的地方室內正中上、下掛著"欽承聖緒"和"詩書禮樂"的大匾，兩旁立著幾塊石碑。二堂兩頭的梢間，東為啟事廳，西為伴官廳。
說實話，吳國金此時走的已經有些累了，但是見大隊人馬依然向前面走著。再看身旁的孔興燮也陪著笑臉向前走著，便不動聲色的大步向前，心中卻已經將歷代衍聖公的奢華生活給罵了個遍。
在二堂之後，有個不大的庭院，在庭院裡有兩棵沖天挺拔的蒼檜並列兩旁，還有六個石雕盆內各立一塊奇形怪狀的太湖石，此院的北屋即是三堂。
孔府的三堂也叫退廳，是衍聖公接見四品以上官員的地方，也是他們處理家族內部糾紛和處罰府內僕役的場所，此院的東西配房各有一進院落，東為冊房掌管公府的地畝冊契，內為司房掌管公府的總務和財務；西為書房，為當年公府的文書檔案室。
此時吳國金等人進入三堂院內之後，便看到了兩面的配房和跨院，上面都寫有匾額。
於是吳國金笑了笑，立即命隨行的部下上前，先將東面的孔府司房、西面的衍聖公書房封鎖起來，孔府內的任何人，包括衍聖公孔興燮都不得再出入這兩處。
“將裡面的賬簿、記錄、文卷、書冊、圖集等，全部就地查封，不能放過任何蛛絲馬跡！”
“是！”
此時軍情部的隨行人馬全都身穿飛魚服樣式的統一官服，一個個都是精神抖擻，每個隨行人馬都是人高馬大、器宇軒昂的。
在孔興燮等孔家人的眼裡，這些人馬全都是錦衣衛的樣貌，隨著吳國金的一聲令下，這些“錦衣衛”已經開始查封抄家了！
“大人啊！”
孔興燮被嚇得大喊一聲，臉色越發的慘白，周圍不少人都是面色悲慼。
吳國金見狀則是冷笑一聲，一把拉住孔興燮，說道：“衍聖公這是何意？本部堂不過是例行公事罷了。如果此番衍聖公只是忠心為國上書，則一切都沒有問題，更不用慌張的。不過……”
吳國金的語氣突然陰冷了起來，說道：“不過如果衍聖公真的結黨營私，背後還有一黨，此番上書也不是出於什麼忠心，而是別有用心，恐怕……”
“恐怕傳承數百年的衍聖公一脈，到了您這裡就要突生變故了！”
聽了吳國金的話，孔興燮被嚇得搖晃了幾下，差一點就一屁股坐在地上，被左右的族人給攙扶住了。
吳國金見狀不置可否，只是說道：“還請衍聖公繼續帶路，咱們找一個能夠說話的地方，如何！”